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adf:accurateeda-nocvforopenshell_o2-h2

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adf:accurateeda-nocvforopenshell_o2-h2 [2017/05/21 12:09] – [NOCV分析：查看对“轨道相互作用能”做出主要贡献的NOCV] liu.junadf:accurateeda-nocvforopenshell_o2-h2 [2019/12/18 22:07] (当前版本) – [Unrestricted三重态片段的能量分解(EDA)与ETS-NOCV分析：O2-H2] liu.jun
行 1: 行 1:
-======如何使用Unrestricted方法对分子体系进行精确的开壳层片段分析(EDA、ETS-NOCV)：O2-H2======+======Unrestricted三重态片段的能量分解(EDA)与ETS-NOCV分析：O2-H2======
  
 <chem>O2</chem>参与的反应很常见，但<chem>O2</chem>基态实际上是三重态而不是单重态。因此有<chem>O2</chem>参与的片段分析，实际上是开壳层片段分析。本例以<chem>O2</chem>、<chem>H2</chem>作为例子，简单的说明。为了明了起见，我们略过了结构优化的过程。 <chem>O2</chem>参与的反应很常见，但<chem>O2</chem>基态实际上是三重态而不是单重态。因此有<chem>O2</chem>参与的片段分析，实际上是开壳层片段分析。本例以<chem>O2</chem>、<chem>H2</chem>作为例子，简单的说明。为了明了起见，我们略过了结构优化的过程。
- 
-[[https://www.jianguoyun.com/p/DUc113wQmZ2ZBhi_wyw|本例的计算文件下载（点击）]] 
 =====参数设置===== =====参数设置=====
 将体系分为两个区（如何分区，参考[[adf:creatregion]]）： 将体系分为两个区（如何分区，参考[[adf:creatregion]]）：
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 {{ :adf:unrestrictedfragmento2h2_06.png?500 }} {{ :adf:unrestrictedfragmento2h2_06.png?500 }}
  
-其中Spin up（或者叫做Spin A、Spin alpha）有7个电子，另一种自旋右5个电子，这就是我们想要的结果。+其中Spin up（或者叫做Spin A、Spin alpha）有7个电子，另一种自旋有5个电子，这就是我们想要的结果。
 ====键能能量分解（EDA）==== ====键能能量分解（EDA）====
 在ADFjobs窗口选中O2-H2任务，之后点击ADF LOGO > Output > PEDA Energy Terms： 在ADFjobs窗口选中O2-H2任务，之后点击ADF LOGO > Output > PEDA Energy Terms：
行 89: 行 87:
  =====================================================================  =====================================================================
 </code> </code>
-表示EDA分析中，Spin 1（也就是Spin alpha）对“轨道相互作用能”没有明显的贡献，所有alpha电子轨道的贡献加起来是-0.9KJ/mol。Spin 2（也就是Spin beta）对“轨道相互作用能”贡献较大的，有一组NOCV，本征值为-0.0543、+0.0543，贡献了-1.9KJ/mol，其他beta电子贡献了-0.7 kJ/mol。其中本征值的正负的含义，参考：[[adf:theoryofets-nocv]]。下文中也略作说明。+表示EDA分析中，Spin 1（也就是Spin alpha）对“轨道相互作用能”没有明显的贡献，所有alpha电子轨道的贡献加起来是-0.9KJ/mol。Spin 2（也就是Spin beta）对“轨道相互作用能”贡献较大的，有一组NOCV，本征值为-0.0543、+0.0543，贡献了-1.9KJ/mol，其他所有beta电子贡献加起来是-0.7 kJ/mol。其中本征值的正负的含义，参考：[[adf:theoryofets-nocv]]。下文中也略作说明。
 ====NOCV分析：查看对“轨道相互作用能”做出主要贡献的NOCV==== ====NOCV分析：查看对“轨道相互作用能”做出主要贡献的NOCV====
-ADF LOGO > View > Fields → Grid → Fine, Add → Isosurface (Double(+/-)，然后在窗口底部的Select Field选择NOCV orbitals，分别选择Spin为B（A表示alpha电子、B表示beta电子），本征值分别为-0.0543、+0.0543的两个NOCV，显示如下：+ADF LOGO > View > Fields → Grid → Fine, Add → Isosurface: With Phase，然后在窗口底部的Select Field选择NOCV orbitals，分别选择Spin为B（A表示alpha电子、B表示beta电子），本征值分别为-0.0543、+0.0543的两个NOCV，显示如下：
  
 {{ :adf:unrestrictedfragmento2h2_07.png?600 }} {{ :adf:unrestrictedfragmento2h2_07.png?600 }}
行 99: 行 97:
 其中，将NOCV设置为透明的显示，可以参考：[[adf:transparrency]] 其中，将NOCV设置为透明的显示，可以参考：[[adf:transparrency]]
  
-其中Spin为B、本征值为-0.0543的这个，列出的是<chem>O2</chem>片段、<chem>H2</chem>片段，其中一个的占据轨道和另一个的空轨道。成键的时候，是这两个轨道在产生“轨道相互作用”（本例中，也就是<chem>O2</chem>的占据轨道和<chem>H2</chem>的空轨道。一般空轨道比占据的A轨道略“胖”。分别查看两个片段的电子占据方式、在View窗口查看轨道的形状，也可以通过对照，得到这个信息）。+其中Spin为B、本征值为-0.0543的这个，列出的是<chem>O2</chem>片段、<chem>H2</chem>片段，其中一个片段的占据轨道和另一个片段的空轨道。成键的时候，是这两个轨道在产生“轨道相互作用”（本例中，也就是<chem>O2</chem>的占据轨道和<chem>H2</chem>的空轨道。一般空轨道比占据的A轨道略“胖”。分别查看两个片段的电子占据方式、在View窗口查看轨道的形状，也可以通过对照，得到这个信息）。
  
-本征值为-0.0543的那组空占轨道由于“轨道相互作用”而形成“键”(注意，这里是广义的“键”，包括氢键、物理吸附等)的样子。电子跑到了这个NOCV轨道上，而<chem>H2</chem>上的那部分，原本是空轨道，因此实际上成键的时候，有相当多电子跑到了该区域。+本征值为-0.0543的那组空占轨道由于“轨道相互作用”而形成“键”(注意，这里是广义的“键”，包括氢键、物理吸附等)的样子，就是上面本征值为+0.0543的那个NOCV轨道。电子跑到了这个NOCV轨道上，而<chem>H2</chem>上的那部分，原本是空轨道，因此实际上成键的时候，有相当多电子跑到了该区域。
adf/accurateeda-nocvforopenshell_o2-h2.1495339774.txt.gz · 最后更改: 2017/05/21 12:09 由 liu.jun

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