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adf:accurateeda-nocvforopenshell

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adf:accurateeda-nocvforopenshell [2017/05/21 09:57] – [如何对分子体系进行精确的开壳层片段分析(EDA、ETS-NOCV)] liu.junadf:accurateeda-nocvforopenshell [2019/12/18 22:08] (当前版本) – [前言] liu.jun
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-======如何对分子体系进行精确的开壳层片段分(EDAETS-NOCV)两个二重态的“片段”,构成单重态的“整体”====== +======Unrestricted二重态片段的能量(EDA)与ETS-NOCV分析CH3-CH3======
 =====前言===== =====前言=====
-对于开壳层片段,例如我们想精确地知道两个甲基形成乙烷,这个成键、键能、alpha电子和beta电子是如何成键的,ADF模块使用Restricted方法计算(这本身带来了一定的误差)开壳层片段的时候,尤其是对于高自旋态(三重态及其以上),如果分别指定alpha、beta电子,往往很难收敛到正确的占据方式上;如果使用类似A 14 1 1的指定方式,电子却又是均匀分布在alpha、beta上的,而通过Fragmentoccupations再指定一遍A 7 / / 9,程序内部实际上用之前A 7 0.5 0.5/ / 7 0.5 0.5的占据,做了1次迭代,然后直接将电子按照A 7 / / 9的方式占据,然后进行片段分析的整体计算——这是用的最多的一种方式。具体指定电子占据的方式,参考:[[adf:如何为对称性的分子指定电子的占据方式]]。还有一种方法,也被少数人采用,也就是用Unrestricted方法来计算,完成之后,修改*.t21文件,删掉其中一种自旋,修改占据数,伪装成Restricted占据,这带来的误差实际上也相当大。 
- 
-BAND模块弥补了这方面的缺陷,支持使用Unrestricted方法来计算整个体系,所有的片段的计算,也都可以用Unrestricted方法来计算。如此,片段的轨道就可以被精确处理,而且即使对高自旋态,电子也能收敛到正确的占据方式上面去。 
  
 本例以两个甲基形成乙烷为例。 本例以两个甲基形成乙烷为例。
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 ====NOCV分析:查看对“轨道相互作用能”做出主要贡献的NOCV==== ====NOCV分析:查看对“轨道相互作用能”做出主要贡献的NOCV====
-ADF LOGO > View > Fields → Grid → Fine, Add → Isosurface (Double(+/-)+ADF LOGO > View > Fields → Grid → Fine, Add → Isosurface: With Phase
  
 {{ :adf:unrestrictedopenshelleda08.png?600 }} {{ :adf:unrestrictedopenshelleda08.png?600 }}
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 其中,将NOCV设置为透明的显示,可以参考:[[adf:transparrency]] 其中,将NOCV设置为透明的显示,可以参考:[[adf:transparrency]]
  
-其中Spin为A、本征值为-0.4736的这个,列出的是左边片段、右边片段,其中一个的占据轨道和另一个的空轨道。成键的时候,是这两个轨道在产生“轨道相互作用”(ADF模块使用Unrestricted计算<chem>CH3</chem>,可以发现AA不可约表示的4号轨道Spin A是占据的、Spin B是空的,其中空的B这个轨道比占据的A轨道略“胖”。分别查看两个片段的电子占据方式,也可以得到这个信息)。那么很显然是左边的甲基<chem>sp3</chem>杂化形成的一个未配对的alpha电子(按CTRL -缩小原子,可以看的更清楚一些,如下图所示)和右边甲基的<chem>sp3</chem>杂化形成的alpha空轨道在发生“轨道相互作用”;Spin B的情况类似,不过是反过来的。+其中Spin为A、本征值为-0.4736的这个,列出的是左边片段、右边片段,其中一个的占据轨道和另一个的空轨道。成键的时候,是这两个轨道在产生“轨道相互作用”(ADF模块使用Unrestricted计算<chem>CH3</chem>,可以发现AA不可约表示的4号轨道Spin A是占据的、Spin B是空的,其中空的B这个轨道比占据的A轨道略“胖”。分别查看两个片段的电子占据方式,也可以得到这个信息)。那么很显然是左边的甲基<chem>SP3</chem>杂化形成的一个未配对的alpha电子(按CTRL -缩小原子,可以看的更清楚一些,如下图所示)和右边甲基的<chem>SP3</chem>杂化形成的alpha空轨道在发生“轨道相互作用”;Spin B的情况类似,不过是反过来的。
  
 {{ :adf:unrestrictedopenshelleda11.png?600 }} {{ :adf:unrestrictedopenshelleda11.png?600 }}
  
-其中Spin为A、本征值为0.4736的这个,表示两个甲基成键之后,左边甲基的那个占据轨道电子和右边甲基的空轨道发生“轨道相互作用”<color blue>之后<color>,变成了什么形状。Spin B也可以类似看到,和Spin A的朝向相反。+其中Spin为A、本征值为0.4736的这个,表示两个甲基成键之后,左边甲基的那个占据轨道电子和右边甲基的空轨道发生“轨道相互作用”<color blue>之后</color>,变成了什么形状。Spin B也可以类似看到,和Spin A的朝向相反。
  
 在View窗口可以分别显示所有的轨道的空间分布图。 在View窗口可以分别显示所有的轨道的空间分布图。
adf/accurateeda-nocvforopenshell.1495331879.txt.gz · 最后更改: 2017/05/21 09:57 由 liu.jun

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