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adf:3d-peda [2020/11/30 15:15] – [第二步:设置参数] liu.jun | adf:3d-peda [2022/07/09 12:52] (当前版本) – [第三步:运行任务] liu.jun | ||
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======如何进行三维周期性体系的结合能、能量分解pEDA====== | ======如何进行三维周期性体系的结合能、能量分解pEDA====== | ||
- | 本文使用AMS2019.301完成。以下以体心立方的铁晶体孔状结构吸附H< | + | 以下以体心立方的铁晶体孔状结构吸附H< |
=====第一步:建模===== | =====第一步:建模===== | ||
- | 在免费、开放的[[adf: | + | 在免费、开放的[[https:// |
创建孔洞结构的过程,参考[[adf: | 创建孔洞结构的过程,参考[[adf: | ||
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当然,真正进行计算的时候,需要进行结构优化。但本例中仅演示能量分解的功能,因此省去了结构优化的步骤。 | 当然,真正进行计算的时候,需要进行结构优化。但本例中仅演示能量分解的功能,因此省去了结构优化的步骤。 | ||
- | ======第二步:设置参数====== | + | =====第二步:设置参数===== |
设置参数如下: | 设置参数如下: | ||
- | 泛函、基组的选择,可以参考[[adf: | + | 泛函、基组的选择,可以参考:[[adf:basis_band]]。因为是研究分子吸附,所以这里选择了色散修正泛函PBE-D3(BJ),也可以使用D4-(EEQ)。 |
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- | **为能量分解设置片段区域,设置方法,如果没有做过的话,务必参考[[adf: | + | **为能量分解设置片段区域,设置方法,如果没有做过的话,务必参考[[adf: |
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设置完成后,File > Save As,保存任务。 | 设置完成后,File > Save As,保存任务。 | ||
- | ======第三步:运行任务====== | + | =====第三步:运行任务===== |
提交任务的方式,参考[[adf: | 提交任务的方式,参考[[adf: | ||
- | ======第四步:结果查看====== | + | =====第四步:结果查看===== |
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- | 查看结果文件,参考[[adf: | + | |
打开*.out文件,点击Properties > PEDA Energy Terms即可看到能量分解的情况。其中△E< | 打开*.out文件,点击Properties > PEDA Energy Terms即可看到能量分解的情况。其中△E< |