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sw:快速测量_直方图_剖面线_点_距离和角度

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sw:快速测量_直方图_剖面线_点_距离和角度 [2023/09/26 23:13] – 创建 liu.ningsw:快速测量_直方图_剖面线_点_距离和角度 [2023/09/27 14:59] (当前版本) – liu.ning
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 ====== 快速测量：直方图、剖面线、点、距离和角度 ====== ====== 快速测量：直方图、剖面线、点、距离和角度 ======
  
 +本教程将演示如何充分使用 Simpleware ScanIP 中的快速测量工具，包括可应用于 2D 切片、3D 模型或同时适用于两者的点、距离和角度工具。此外，任何测量记录都可以存储在 Simpleware ScanIP 的项目文件中。直方图和剖面线工具可用于测量和导出有关特定 2D 切片上的灰度信息。
  
-===== 点测量 ===== 
  
 +本教程所用 Blood_Flow-01.sip 项目文件位于 Simpleware 软件 Windows 版本默认路径 C:\Program Files\Synopsys\Simpleware\U-2022.12\Data\BloodVessel 文件夹下。
 +
 +点击File — Open project 打开 Blood_Flow-01.sip 项目
 +
 +===== 1. 点测量 =====
 +
 +点测量可用于确定特征的坐标或查看某个像素的灰度值。
  
 ==== 2D 点测量 ==== ==== 2D 点测量 ====
  
 +  - 点击 View — 2D slice views — Orientations，选择 Classic 轴向。
 +  - 点击 2D 切片视图左上角放大图标将视图最大化。
 +  - 确定所选为 XY 视图，如果不是，可以在 2D 切片视图上方的切片方向下拉菜单中选择。
 +  - 点击 Measurements — Quick measurements — Measurements，打开设置面板。
 +  - 点击 Point 创建一个点测量，在切片或 3D 模型中点击目标位置。
 +  - 面板中增加一个名为 Point_001 的测量记录，后续新增测量将默认依次命名为 Point_002、Point_003等。
 +
 +{{ :sw:20230926ln01.png?nolink&350 |}}
 +
 +
 +
 +当创建一个点时，面板中随即记录其坐标位置和灰度值，此处灰度值指的是原始 CT/MRI 的灰度值单位。将鼠标悬放在 2D 切片的某一像素点时也将显示该位置的坐标和灰度值。
 +
 +**使用鼠标右键查看更多选项：**
 +右键单击表格标题（Name、Greyscale等）可以显示或隐藏列，设置长度单位、设置角度类型、设置有效数字位数和坐标系（全局或局部）。
 +
 +  * 图像坐标系使用 Simpleware ScanIP 中图像的原点，而全局坐标系是指 MRI/CT 扫描仪或图像数据被裁剪之前的原始原点。还有一些选项可用于切换是否显示注释，测量是否应捕捉到 3D 模型表面或是 2D 剖切片视图中的模型轮廓。
 +  * 右键单击表格栏（如Point_001）可以重命名、删除或更改某些选项。
 +
 +7.为同时查看点测量在 3D 模型中的位置，点击View — View layout — One 2D, 3D，可以分屏展示一个 2D 视图和一个 3D 视图。
 +
 +8.点击 3D 视图上方的快速预览按钮更新 3D 预览。
  
 +{{ :sw:20230926ln02.png?nolink&700 |}}
 ==== 3D 点测量 ==== ==== 3D 点测量 ====
  
 +  - 3D 点测量方法与 2D 点相似。
 +  - 最大化3D 视图。
 +  - 点击 Point 创建点测量。
 +  - 在3D 模型中通过左键单击模型表面的某个位置。
 +  - 面板中 Point_003 即表示该点。
  
-===== 距离测量 =====+===== 2. 距离测量 =====
  
 +距离测量可用于查看模型中两个部分间的距离
  
 ==== 2D 距离测量 ==== ==== 2D 距离测量 ====
 +
 +  - 最大化 2D 视图，滑动鼠标滚轮或视图上方的滑块选择合适的切片。
 +  - 打开 Measurements — Quick measurements — Measurements，点击 Distance 按钮。
 +  - 依次在 2D 视图中点击目标距离的起始点和终点。
 +  - 左键点击拖动线段的两个端点可以移动并重新选择位置
 +  - 测量表格中测量记录显示为 Dist_001。
 +
 +{{ :sw:20230926ln03.png?nolink&500 |}}
 +
 +
 +<WRAP center round tip 100%>
 +随着测量记录越来越多，表中会添加其他列以满足显示不同类型的测量结果。如需自定义显示的列，可右键单击列标题添加或删除列。Show or hide columns 下拉菜单中的 Show relevant 是一个很实用的选项。
 +</WRAP>
 +
 +<WRAP center round info 100%>
 +如果 3D 视图中正在显示模型（通过 Fast preview、Model preview 或 Mesh）且模型轮廓选项已开启（View — 2D slice views — 3D contours — Model/3D view），则测量控制点也将显示在 3D 模型中，有助于准确放置测量点。
 +</WRAP>
 +
  
  
 ==== 3D 距离测量 ==== ==== 3D 距离测量 ====
  
 +  - 最大化 3D 视图。
 +  - 在 Measurements 面板选择 Distance 按钮。
 +  - 在 3D 视图，点击 3D 模型中的两个位置创建两者间的距离测量。
 +  - 点击 View — View layout — One 2D, 3D，分屏展示 2D 视图和 3D 视图中创建点的位置。
 +  - 在 2D 视图中也显示了距离测量，但由于 3D 距离测量并不在该切片内，因此以虚线表示。
  
-===== 角度测量 =====+{{ :sw:20230926ln04.png?nolink&700 |}} 
 + 
 +===== 3. 角度测量 ===== 
 + 
 +在 Simpleware ScanIP 中角度测量可以是通过两个相连的矢量（如 3 个点）或是两个不相连的矢量（如 4 个点）。
  
 ==== 2D 角度测量 ==== ==== 2D 角度测量 ====
 +
 +  - 最大化 2D 视图，选择合适的切片。
 +  - 打开 Measurements — Quick measurements — Measurements，点击 Angle 按钮。
 +  - 在 2D 切片视图选择三个点创建角度，按照点击顺序，第一个和第三个点为端点，第二个点为中心点。
 +  - 使用鼠标拖动各个点的位置可以重新定位，另外也可以通过键盘上的方向键微调。
 +  - 创建的 Angle_001 保存在测量表格中。
 +
 +{{ :sw:20230926ln05.png?nolink&500 |}}
  
  
 ==== 3D 不相连角度测量 ==== ==== 3D 不相连角度测量 ====
  
 +  - 最大化 3D 视图。
 +  - 在 Measurements 面板点击 Disconnected Angle 按钮。
 +  - 在 3D 模型上相继点击 4 个点创建两个矢量。
 +  - 可以在 Angle 的下拉菜单通过 Inner（默认）、Supplementary、Outer 选项计算内角、补角和外角。
  
-===== 多平面重建测量 =====+{{ :sw:20230926ln06.png?nolink&700 |}}
  
 +<WRAP center round tip 100%>
 +测量工具的十字准线颜色可表示该点是否在 3D 模型表面上，绿色说明该点在模型表面，而红色则在自由空间。右键点击测量表格的标题栏，如果勾选 Snap，则选中的点移近模型时，只能停留在模型的表面；取消勾选 Snap 后，可将点移动到模型内部。
 +</WRAP>
  
-===== 导出测量结果 ===== 
  
 +===== 4. 多平面重建测量 =====
  
-===== 直方图和剖面线 =====+多平面重建（MPR）可以通过旋转切片平面进行临时地重建图像，因此用户可以进行冠状、轴位或矢状平面外其他任意平面的测量。 
 + 
 +1.点击 2D 视图工具栏下拉菜单勾选 Multi-planar reconstruction (MPR)，启用切片光标。 
 + 
 + 
 +{{ :sw:20230926ln07.png?nolink&550 |}} 
 + 
 +2.使用鼠标左键在中心附近移动切片光标将其平移到所需位置。 
 + 
 +{{ :sw:20230926ln08.png?nolink&550 |}} 
 + 
 +3.在切线两端，离相交中心较远的位置通过鼠标左键旋转切片至所需位置。再次点击 2D 视图下拉菜单勾选 Lock MPR 锁定当前切片，将不能平移和旋转切片。 
 + 
 +{{ :sw:20230926ln09.png?nolink&550 |}} 
 + 
 +4.调整至理想方向的切片视图后，可采用与之前相同的步骤进行点、距离和角度的测量。 
 + 
 +{{ :sw:20230926ln10.png?nolink&550 |}} 
 + 
 +5.在 2D 视图下拉菜单中勾选 Reset MPR 即可恢复至默认视图位置。 
 + 
 + 
 +===== 5. 导出测量结果 ===== 
 + 
 +  - 首先点击 File — Save as 保存 Simpleware ScanIP 的项目文件，其中也保存了所有记录的测量值，但不包含任何通过 Quick statistics 获得的数据信息。 
 +  - 在 Measurements 面板，点击 Export… 按钮。 
 +  - 可以选择将测量表格以 .csv 或 .txt 格式文件导出。 
 + 
 +===== 6. 直方图和剖面线 =====
  
  
 ==== 直方图工具 ==== ==== 直方图工具 ====
  
 +Histogram 工具可以查看当前活动状态下背景图像、掩膜或可见掩膜的灰度信息。
 +
 +  - 点击 Measurements — Quick measurements — Histogram。
 +  - 默认的 Histogram data 为背景图像的所有切片。
 +  - 将 Histogram data 更改为 Active mask。
 +  - 右键点击直方图，选择 Export。
 +  - 以 .csv 格式文件导出数据。
 +
 +{{ :sw:20230926ln11.png?nolink&350 |}}
  
 ==== 剖面线工具 ==== ==== 剖面线工具 ====
  
-===== 快速统计 =====+Profile line 工具可以沿在 2D 切片视图画的线查看活动背景图像的灰度信息。
  
 +  - 点击 Measurements — Quick measurements — Profile line。
 +  - 在 2D 切片视图中，相继点击两个点画一条剖面线。
 +  - 工具面板将展示沿剖面线方向（以像素为单位）的灰度变化，横坐标也即点的数目。
 +  - 右键点击图表选择 Export 导出绘制该图的统计数据。
 +  - 以 .csv 格式文件导出数据。
 +
 +{{ :sw:20230926ln12.png?nolink&550 |}}
 +
 +
 +===== 7. 快速统计 =====
 +
 +Simpleware ScanIP 的测量栏还提供了快速获取常用数据的工具。只需点击 Quick statistics 区域对应的工具即可，统计对象为当前处于活动状态的掩膜。包含体积、体积分数、表面积、灰度值、质量密度和主要边界长度这 6 个选项。
  
 ==== 体积统计 ==== ==== 体积统计 ====
  
-===== 参考 =====+1.点击 Measurements — Quick statistics — Volume。 
 + 
 +2.Quick general statistics 面板随即显示活动掩膜的体积值。 
 + 
 +{{ :sw:20230926ln13.png?nolink&350 |}} 
 + 
 +3.在 Quick general statistics 面板提供以下选项： 
 + 
 +  * 所选项目的测量值。 
 +  * Measurement type：Voxel 是通过体素立方体统计，Model/3D view 根据 3D 视图展示的真实模型统计。 
 +  * 点击设置按钮可以更改数据的单位。 
 +  * 也可以进行用户自定义感兴趣的数据统计，如利用椭球体 ROI 得到血管中一小部分的体积。 
 +  * 为实现上一步的目的，需要使用 Quick general statistics 面板 Region of interest 下方的工具。 
 +  * 从 Primitive 的下拉菜单 选择 Ellipsoid，在 3D 视图任意位置点击并拖动创建一个椭球体，面板中即时更新了该球体内包含掩膜部分的体积。 
 +  * 可以在 3D 视图或 Position/Dimensions 调整 ROI 的位置和参数。 
 + 
 + 
 +{{ :sw:20230926ln14.png?nolink&400 |}} 
 + 
 +===== 8. 参考 =====
  
   * Simpleware 软件内置教程 Tutorials — Measurements and statistics — Quick Measurements: Histogram, Profile line, point, distance and angles   * Simpleware 软件内置教程 Tutorials — Measurements and statistics — Quick Measurements: Histogram, Profile line, point, distance and angles
sw/快速测量_直方图_剖面线_点_距离和角度.1695741236.txt.gz · 最后更改: 2023/09/26 23:13 由 liu.ning

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