adf:reaxff模块计算过程中的常见问题及解决

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--- adf:reaxff模块计算过程中的常见问题及解决 [2023/02/21 10:02] – [理论与理解] liu.jun
+++ adf:reaxff模块计算过程中的常见问题及解决 [2024/05/15 13:04] (当前版本) – [报错] liu.jun
@@ 行 9: / 行 9: @@
   * [[adf:rateunittransfer]]
   * [[adf:openmpin2019]]
+  * [[adf:reaxffforionics]]
+  * [[adf:productsdifferent]]
+  * [[adf:ctrleforprotien]]
 =====设置参数=====
   * [[adf:同位素的设置]]
@@ 行 15: / 行 18: @@
   * [[adf:processing]]
   * [[adf:setchageformolecule]]
-  * [[adf:fixatomsinreaxff]]
   * [[adf:fixpositionin2021]]
   * [[adf:bondordercutoof]]
@@ 行 24: / 行 26: @@
   * [[adf:followcertainatoms]]
   * [[adf:bondordercutoff]]
-  * [[adf:shakeofmd]]
   * [[adf:initialvelocitiesperatom]]
   * [[adf:atomtooclose]]
-  * [[adf:shakeinMD]]
 =====图形界面与特殊操作=====
@@ 行 52: / 行 52: @@
   * [[adf:selectcertainmol]]
   * [[adf:exportcharges]]
+  * [[adf:showatomsregion]]
+  * [[adf:notresponde]]
 =====结果处理=====
   * [[adf:distributionofzaxis]]
+  * [[adf:totalnumberpfmols]]
   * [[adf:conservedenergy]]
   * [[adf:dipoleacf]]
   * [[adf:generatebondsconn]]
   * [[adf:connectrkf]]
+  * [[adf:coordsinamsrkf]]
+  * [[adf:energytermsoftrajectory]]
 ===== 报错 =====
   * [[adf:atomstooclose]]
+  * [[adf:sigterm]]
+  * [[adf:laticevectorerroe]]
+  * [[adf:missingbonds]]
   * [[adf:*.out文件中出现NaN字样]]
   * [[adf:Fatal: Unknown bond in molecule]]
@@ 行 76: / 行 85: @@
   * [[adf:velocitytoolarge]]
   * [[adf:ProcessreceivedSIGSEGV]]
+  * [[adf:chemtrayzer2.0]]
+  * [[adf:157fort]]
+  * [[adf:fixedmolgun]]
+  * [[adf:ompcannotbalance]]
+=====PLAMS=====
+  * [[adf:findbond]]

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