点击AMSinput右边窗口的Model > Region。选中希望创建为“第一个区域的所有原子”，选中这些原子的方法，参考AMSinput常用快捷键，被选中的原子，将会高亮显示。

1. 点击Regions旁边的“+”号，则创建了第一个区域；
2. 点击左边窗口的空白处，原先被选中的原子就不再被选中了，之后重新选择要被划分为“第二个区域的所有原子”，再点击“+”号，如此则创建了第二个区域；
3. 以此类推

创建 region 时，有一些技巧，例如我们希望追踪某个产物中的一些原子，是否来自特定反应物，那么在 Input 中创建 region 时，选中一个这种反应物分子，然后该 region 右侧的下三角按钮：

将会把所有同类分子都加入该 region 中。

与上述方法相同，只选中该分子中的特定原子，然后创建region，同样Add Region In Same Way To Identical Molecules，则所有这类分子对应的这一个/几个原子都被选中、添加到该Region了。