用户工具

站点工具


adf:fdeforsolvation

差别

这里会显示出您选择的修订版和当前版本之间的差别。

到此差别页面的链接

两侧同时换到之前的修订记录前一修订版
后一修订版
前一修订版
adf:fdeforsolvation [2017/03/27 21:42] – [其他:如何处理溶剂对溶质紫外、轨道、NMR等性质的影响] liu.junadf:fdeforsolvation [2021/07/26 10:37] (当前版本) – [2,使用FDE方法精确考虑溶剂的影响] liu.jun
行 1: 行 1:
-======实验计算比:如何处理溶剂对溶质紫外、轨道、NMR等性质的影响======+======实验-计算比:溶剂对溶质紫外、轨道、NMR等性质的影响======
  
-本文以亚丙基丙酮为例,介绍DFT计算中,通过各种方式去考虑溶剂化对溶质分子的轨道、静电势、紫外吸收光谱、NMR性质等的影响。本文对比了气态亚丙基丙酮、水溶液、氯仿溶液中的情况。包括如下几个计算+本文以亚丙基丙酮为例,介绍DFT计算中,通过各种方式去考虑溶剂化对溶质分子的轨道、静电势、紫外吸收光谱、NMR性质等的影响。本文对比了气态亚丙基丙酮、水溶液、氯仿溶液中的情况。包括如下几个内容
  
   - 气态亚丙基丙酮(也就是孤立的亚丙基丙酮分子)的紫外光谱计算   - 气态亚丙基丙酮(也就是孤立的亚丙基丙酮分子)的紫外光谱计算
   - 使用FDE方法精确考虑溶剂的影响:1)亚丙基丙酮在水分子环绕下的紫外光谱计算;2)亚丙基丙酮在氯仿分子环绕下的紫外光谱计算   - 使用FDE方法精确考虑溶剂的影响:1)亚丙基丙酮在水分子环绕下的紫外光谱计算;2)亚丙基丙酮在氯仿分子环绕下的紫外光谱计算
-  - 使用COSMO均匀介质模型精确考虑溶剂的影响:1)亚丙基丙酮在水分子环绕下的紫外光谱计算;2)亚丙基丙酮在氯仿分子环绕下的紫外光谱计算+  - 使用COSMO均匀介质模型精确考虑溶剂的影响:1)亚丙基丙酮在水溶液中的紫外光谱计算;2)亚丙基丙酮在氯仿水溶液中的紫外光谱计算
   - FDE溶剂化计算的其他性质   - FDE溶剂化计算的其他性质
 ===== 实验结果===== ===== 实验结果=====
行 12: 行 12:
 {{ :adf:fdeforsolvation01.png?350 |}} {{ :adf:fdeforsolvation01.png?350 |}}
  
-溶剂分别使得波长最长的两个吸收峰红移、蓝移;溶剂的极性越小,溶剂极性越小,移动量越小。不过本文只计算了后面两溶剂的情况。+溶剂分别使得波长最长的两个吸收峰红移、蓝移;溶剂的极性越小,移动量越小。不过本文只计算了后面两溶剂的情况。
  
 =====1,气态亚丙基丙酮的紫外光谱计算===== =====1,气态亚丙基丙酮的紫外光谱计算=====
行 18: 行 18:
  
 =====2,使用FDE方法精确考虑溶剂的影响===== =====2,使用FDE方法精确考虑溶剂的影响=====
-  * [[adf:Propylacetoneinwater|亚丙基丙酮在水分子环绕下的紫外光谱计算]] +  * [[adf:Propylacetoneinwater2020|亚丙基丙酮在水分子环绕下的紫外光谱计算]]
-  * 亚丙基丙酮在氯仿分子环绕下的紫外光谱计算(计算方法参考前者,[[https://www.jianguoyun.com/p/DfsnalAQmZ2ZBhi97ig|结构优化计算文件下载]]、[[https://www.jianguoyun.com/p/DUDaRHsQmZ2ZBhjA7ig|紫外可见吸收计算文件下载]])+
  
 结果: 结果:
-  * 在水溶剂中,计算得到两个吸收峰:313nm、236nm +  * 在水溶剂中,计算得到两个吸收峰:313nm、236nm{{ :adf:c6h10o-water-ex.zip |计算文件下载}} 
-  * 在氯仿溶剂中,计算得到两个吸收峰:316nm、234nm+  * 在氯仿溶剂中,计算得到两个吸收峰:316nm、234nm{{ :adf:c6h10o-chcl3-ex.zip |计算文件下载}}
  
 可以看到与实验结果定性上一致: 可以看到与实验结果定性上一致:
行 31: 行 30:
 =====3,使用COSMO均匀介质模型精确考虑溶剂的影响===== =====3,使用COSMO均匀介质模型精确考虑溶剂的影响=====
   * [[adf:Propylacetoneincosmowater|亚丙基丙酮在水溶液中的紫外光谱计算]]   * [[adf:Propylacetoneincosmowater|亚丙基丙酮在水溶液中的紫外光谱计算]]
-  * 亚丙基丙酮在氯仿溶液中的紫外光谱计算(计算方法参考前者,[[https://www.jianguoyun.com/p/DX3jTrUQmZ2ZBhjL7ig|紫外可见吸收计算文件下载]])+
  
 结果: 结果:
-  * 在水溶剂中,计算得到两个吸收峰:317nm、248nm +  * 在水溶剂中,计算得到两个吸收峰:317nm、248nm{{ :adf:c6h10o-cosmo-water-ex.zip |计算输入输出文件下载}} 
-  * 在氯仿溶剂中,计算得到两个吸收峰:324nm、242nm+  * 在氯仿溶剂中,计算得到两个吸收峰:324nm、242nm{{ :adf:c6h10o-cosmo-chloroform-ex.zip |计算输入输出文件下载}}
  
 可以看到与实验结果定性上一致: 可以看到与实验结果定性上一致:
行 47: 行 46:
 ====轨道==== ====轨道====
 在上述的激发态计算中,实际上已经得到了溶质的轨道,可以直接查看(如果去掉激发态计算的设置,则只计算基态,也可以得到轨道): 在上述的激发态计算中,实际上已经得到了溶质的轨道,可以直接查看(如果去掉激发态计算的设置,则只计算基态,也可以得到轨道):
-点击ADF LOGO > View > Add > Isosurface: Doble(+/-):> 窗口下方Select Field > Orbitals (Occupied),可以查看占据轨道的形状(例如HOMO):+点击ADF LOGO > View > Add > Isosurface: With Phase> 窗口下方Select Field > Orbitals (Occupied),可以查看占据轨道的形状(例如HOMO):
  
 {{ :adf:fdeforsolvation17.png?500 }} {{ :adf:fdeforsolvation17.png?500 }}
行 61: 行 60:
 ====NMR==== ====NMR====
  
-本例中,没有勾选NMR的性质。实际上,上述紫外可见FDE溶剂化计算,可以去掉激发态的设置,勾选NMR的设置,保留FDE的设置,则可以得到在溶剂存在的情况下,溶质分子的NMR性质。NMR性质的计算,参考[[adf:nmrshielding]]、[[adf:nmr-openshell]],也就是在FDE设置的情况下,勾选如下图所示的内容:+本例中,没有勾选NMR的性质。实际上,上述紫外可见FDE溶剂化计算,可以去掉激发态的设置,勾选NMR的设置,保留FDE的设置,则可以得到在溶剂存在的情况下,溶质分子的NMR性质。NMR性质的计算,参考[[adf:1hnmrwithssc]]、[[adf:nmr-openshell]],也就是在FDE设置的情况下,勾选如下图所示的内容:
  
 {{ :adf:nmr02.jpeg?600 }} {{ :adf:nmr02.jpeg?600 }}
adf/fdeforsolvation.1490622173.txt.gz · 最后更改: 2017/03/27 21:42 由 liu.jun

© 2014-2022 费米科技(京ICP备14023855号