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atk:neb方法研究pt在pt表面的扩散 [2016/11/02 16:46] – [分析结果] dong.dong | atk:neb方法研究pt在pt表面的扩散 [2018/03/20 22:21] (当前版本) – liu.jun | ||
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======NEB方法研究Pt在Pt表面的扩散====== | ======NEB方法研究Pt在Pt表面的扩散====== | ||
=====前言===== | =====前言===== | ||
- | 在本文中将演示如何使用 Nudged Elastic Band (NEB) 方法研究扩散及其能垒。作为范例,将计算 Pt 原子在 Pt(100) 表面两种不同扩散机制的能垒 < | + | 本教程演示如何使用 Nudged Elastic Band (NEB) 方法研究扩散反应及其能垒。作为范例,将计算 Pt 原子在 Pt(100) 表面两种不同扩散机制的能垒 < |
+ | 主要包含如下内容: | ||
* 创建并使用 ATK-Classical 优化 Pt 晶体结构; | * 创建并使用 ATK-Classical 优化 Pt 晶体结构; | ||
* 创建包含一个吸附 Pt 原子的 Pt(100) 表面; | * 创建包含一个吸附 Pt 原子的 Pt(100) 表面; | ||
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* 分析结果并与文献对比。 | * 分析结果并与文献对比。 | ||
- | 关于构建、优化 NEB 计算的参数的更详细信息,请参阅[[http:// | + | 关于构建、优化 NEB 计算的参数的更详细信息,请参阅[[http:// |
- | <WRAP center | + | <WRAP center box 100%> |
=== 注意 === | === 注意 === | ||
- | NEB 方法需要用户对初始结构、末态结构以及路径进行预先设定,这通常是必须的。不过,使用其他非常强大方法,比如 | + | NEB 方法需要用户对初始结构、末态结构以及路径进行预先设定,这通常是必须的。不过,使用其他非常强大方法,比如 |
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=====参考文献===== | =====参考文献===== | ||
- | + | * [1] G.L. Kellog and P.J. Feibelman “Surface Self-Diffusion on Pt(001) by an Atomic Exchange Mechanism” Phys. Rev. Lett. 64, 3143 (1990) PhysRevLett.64.3143 | |
- | [1] G.L. Kellog and P.J. Feibelman “Surface Self-Diffusion on Pt(001) by an Atomic Exchange Mechanism” Phys. Rev. Lett. 64, 3143 (1990) PhysRevLett.64.3143 | + | |
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- | [2] P.J. Feibelman “Surface-diffusion mechanism versus electric field: | + | |
- | + | * 英文教程原文:http:// | |
- | [3] X.W. Zhou, et al. “Misfit-energy-increasing dislocations in vapor-deposited CoFe/NiFe multilayers” Phys. Rev. B 69, 144113 (2004) PhysRevB.69.144113 | + | |
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- | [4] Smidstrup et al. “Improved initial guess for minimum energy path calculations” J. Chem. Phys. 140, 214106 (2014) | + |