Job Manager支持设置设置远程服务器提交任务，该方法的特点是：

• 安全：仅使用SSH端口的加密通信；服务器端无需后台进程，无需单独开放其他端口，有效保障安全性，特别适合公共服务器上部署计算；
• 简单：支持自动创建任务文件夹和提交脚本，不需要终端登录服务器进行任务提交；
• 强壮：任务成功提交之后，即可断开与服务器的连接；不必担心网络问题造成的计算中断；无后台进程、数据库等复杂配置，更强壮；
• 便捷：随时可以联机查看即可查看任务、下载计算结果。

从2017版开始，设置使用Job Manager向服务器提交作业变得格外方便。

QuantumATK中支持两种在远程服务器上运行的方式：

• Direct：即服务器上没有PBS等队列系统，提交的计算直接在登录的主机上运行。这种方法常试用于单节点的服务器。
• 通过服务器的队列系统提交：对于大型集群，推荐使用这种方法，目前支持PBS、LSF、SLURM等三种作业队列管理系统。

• 首先确定要在服务器上哪个账户下运行ATK计算，使用终端正确登录服务器，在合适的位置创建一个文件夹用于存放运行ATK产生的文件（例如$HOME/atkjobs）；
• 点击“New”选择“Remote Direct”；

• 在Settings里设置名称、IP地址（或主机名、域名）、端口（SSH默认为22），登录的用户名；

• 点击+，选择一个妥善的保存路径，点击Create生成SSH Key（显示Successfully Generated），下方输入服务器登录的用户名和密码，点击Upload上传SSH Key

• 在Environment中设置保存计算任务的文件夹、mpi执行命令、要source的脚本（根据服务器一般提交任务的脚本进行设置，、要export的环境变量（变量前不用加export命令）、Modules to load等；

• 在Resources里设置任务使用的计算资源(注：这里设置的是默认运行一个作业的计算资源，提交计算时还可以根据实际情况调整)；

之后可以使用diagnostics诊断设置是否正确，当所有项目显示对号时即完成了配置。

这里以PBS为例。

• 点击“New”选择“Remote PBS”

• 在Settings里设置：
  • Machine Name：可以自定义一个服务器的名称；
  • Hostname：通常为服务器的IP地址（或主机名、域名）
  • Port：默认端口为22
  • Username：登录服务器的用户名
  • Queue Name：PBS队列名称，可以输入多个，使用逗号分隔；
  • Path to PBS binaries: PBS（或Torque）命令位置（不含命令本身），可在终端中使用which qsub命令查看。

• 点击+，选择一个妥善的保存路径，点击Create生成SSH Key（显示Key Generated），下方输入服务器登录的用户名和密码，点击Upload上传SSH Key；

• 在Environment中设置：
  • Working directory：保存计算任务的文件夹
  • ATK executable path: atkpython命令的位置
  • mpiexec executable: mpi命令的位置；
  • Script to source:要source的脚本（根据服务器一般提交任务的脚本进行设置，建议将mpi PATH等环境变量放在这里）
  • Export statements：要export的环境变量（变量前不用加export命令）；
  • Modules to load：某些大型服务器要加载的模块；
  • Raw submission text：自定义的PBS脚本命令，直接写入PBS脚本。

• 在Resources里设置任务使用的计算资源
  • number of nodes：提交计算要请求的节点数
  • numer of cores per node: 每个节点的核心数
  • Enable MKL_DYNAMIC：是否使用MKL的动态线程（实际并行效果需根据系统情况测试）

• 在Notification里设置作业状态检查和提醒的选项
  • 设置检查作业状态的时间间隔
  • 邮件提醒需要服务器PBS系统支持。

• 最后在Diagnostics里检查配置是否正常，出现任何错误时，根据提示对前面的设置进行修改。

如果以上设置没有问题，可以尝试提交任务。将作业脚本发送至job manager，选择相应的队列，点击开始按钮即可开始提交计算。 计算一旦开始排队或运行，VNL即可关闭，并断开网络连接。下次连接时，VNL会自动检测作业进度并下载文件。

在提交任务时，用户仍有机会修改每个提交任务的计算设置，方法是：

• 向队列提交任务后不立即点击“开始运行按钮”，此时可以点击 Job Setting 按钮修改计算设置：

• 在Resource选项卡中可以临时修改此计算任务的计算资源（与上面队列设置类似）：

• 在IO选项中可以临时设定此计算任务的目录和要上传的其他文件（对于Analysis from File计算经常非常有用）：

提交任务遇到问题时，需要针对具体问题编辑设置。

提交任务的PBS脚本的详细设置请参考：通过命令行方式手动提交QuantumATK计算。