差别

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--- atk:碳纳米管的封口 [2018/08/13 23:06] – [结构的定型] xie.congwei
+++ atk:碳纳米管的封口 [2019/06/29 15:45] (当前版本) – dong.dong
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   * 将“帽子”粘在纳米管上。
   * 整理一下。
+<WRAP center info 100%>
+=== 提示 ===
+**本教程使用特定版本的QuantumATK创建，因此涉及的截图和脚本参数可能与您实际使用的版本略有区别，请在学习时务必注意。**
+  * 不同版本的QuantumATK的py脚本可能不兼容；
+  * 较新的版本输出的数据文件默认为hdf5；
+  * 老版本的数据文件为nc文件，可以被新版本读取。
+</WRAP>
 在本教程我们将创建一个由 C<sub>60</sub> 半球体盖上的（5, 5）碳纳米管。虽然已经有很多纳米管和富勒烯的组合，但运用本教程的方法可以创建一个加帽的纳米管。
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 ===== 结构的定型 =====
-此时有一些重叠的原子，实际上是我们利用它们创建的结构。您可以使用 Move 工具里的“Fuse”，但是有些原子只是几乎重叠的情况而不会被检测到。
+此时有一些重叠的原子，实际上是我们利用它们创建的结构。您可以使用 Move 工具里的 “Fuse”，但是有些原子只是几乎重叠的情况而不会被检测到。
-  - 代替地，您可以选择 **Move** 工具，打开 Selection tools {{:atk:arrow.png?direct&5|}}Close Neighbors，输入距离为 0.7 Å，按下“//Select//”（应该会有10个原子被选中），然后点击 ''Delete''。
+  - 代替地，您可以选择 **Move** 工具，打开 Selection tools {{:atk:arrow.png?direct&5|}} Close Neighbors，输入距离为 0.7 Å，按下“//Select//”（应该会有10个原子被选中），然后点击 ''Delete''。
   - 将所有的原子改回碳原子。
-  - 由于富勒烯的半径与纳米管的稍有不同，您需要优化帽子。然而，您将想要同时保持纳米管的另一端保持不变（完全的周期性），如果需要的话，方便稍后可以做扩展。因此，首先选择帽子和纳米管中的几层原子（大约是纳米管的一半就可以）。然后，打开 Coordinate Tools {{:atk:arrow.png?direct&5|}} Quick Optimizer，设置最大迭代次数为 100，点击“//Run//”。该工具采用 //ATKClassical// 势，因此优化只需要几秒钟。
+  - 由于富勒烯的半径与纳米管的稍有不同，您需要优化帽子。然而，您将想要同时保持纳米管的另一端保持不变（完全的周期性），如果需要的话，方便稍后可以做扩展。因此，首先选择帽子和纳米管中的几层原子（大约是纳米管的一半就可以）。然后，打开 Coordinate Tools {{:atk:arrow.png?direct&5|}} Quick Optimizer，设置最大迭代次数为 100，点击 “//Run//”。该工具采用 //ATKClassical// 势，因此优化只需要几秒钟。
 {{ :atk:nano_17-20180813.png |}}
+**与其它结构连接**
+单独构建这个结构没有太大意义，您会想要把它连接到某些结构上，如表面或分子。这些内容将在其他教程中介绍，您可以学习如何构建如下图所示的结构。
-===== 结构的定型 =====
+{{ :atk:nano_note_1-20180813.jpeg |}}
+{{ :atk:nano_note_2-20180813.jpeg |}}
+下面是使用非常类似的方法构建的其他封端纳米管的组合。这些体系构建起来要稍微更难，因为需要一些手动调整。
+**（9, 0）CNT+C<sub>60</sub>**
+帽子的顶端为六边形，管的边缘为锯齿形。
+{{ :atk:nano_note_3-20180813.jpeg?200 |}}
+**（6, 6）CNT+富勒烯**
+帽子的顶端由 QuantumATK 数据库里的 No. 134 富勒烯（C<sub>3V</sub> 对称）构成。
+{{ :atk:nano_note_4-20180813.jpeg?200 |nano_note_4}}
+===== 参考 =====
+  * 英文原文：[[https://docs.quantumwise.com/tutorials/cnt_capping/cnt_capping.html|https://docs.quantumwise.com/tutorials/cnt_capping/cnt_capping.html]]

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