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atk:用分子动力学方法模拟液体的粘度

这是本文档旧的修订版!


用分子动力学方法模拟液体的粘度

版本:P-2019.03

在本教程中,您将以液态甲醇为例学习如何采用分子动力学(MD)模拟计算不同液体的粘度。理解粘度对许多工业化学过程的设计至关重要,因为粘度描述了液体的流动。本教程演示了您将如何利用 QuantumATK 工具模拟简单液体的粘性。该方法也可以应用于许多更为复杂和混合的液体。

为了模拟液体甲醇的行为,我们采用经典的分子动力学生成分子的运动轨迹。这些轨迹提供了统计计算液体综合性能所需的必要信息。本教程还演示了如何设置和使用为这类分子问题创建的特定键合力场。

理论

分子粘性

力场

计算步骤

构建初始分子构型

为计算添加力场

原子标签

键合

键角
扭转
范德瓦尔斯
静电

弛豫起始结构

优化结构
获得合适的密度

平衡结构

设置生成计算

修改脚本

添加扭转项
定义 hook 函数
在分子动力学模拟中使用 hook 函数

运行计算

结果分析

观察压力变化

由 Einstein 关系式计算粘度

由 Green-Kubo 关系式计算粘度

扩展结果

运行更多独立轨迹

提高准确性

atk/用分子动力学方法模拟液体的粘度.1569762271.txt.gz · 最后更改: 2019/09/29 21:04 由 xie.congwei

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