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--- atk:如何弛豫器件体系的几何结构 [2016/09/28 15:20] – [如何弛豫器件体系的几何结构] dong.dong
+++ atk:如何弛豫器件体系的几何结构 [2018/03/20 18:40] (当前版本) – liu.jun
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 ====== 如何弛豫器件体系的几何结构 ======
-在使用VNL-ATK进行器件（Device）模型的计算时，如何进行可靠的进行结构优化是常常困扰用户，尤其是初学者的重要问题。在这篇教程中，你会学习到如何利用“刚性”（rigid body）结构限制和简单的优化步骤，来快速、可靠的弛豫一个器件结构的内坐标。
+在使用QuantumATK进行器件（Device）模型的计算时，如何进行可靠的进行结构优化是常常困扰用户，尤其是初学者的重要问题。在这篇教程中，你会学习到如何利用“刚性”（rigid body）结构限制和简单的优化步骤，来快速、可靠的弛豫一个器件结构的内坐标。
 本教程中针对的是一个 A、B 方向上为周期性结构的 “三维” 器件，尤其值得注意的是两端电极是不同种材料构成，这导致了在构建界面时的晶格匹配和由于 A、B 方向应力导致的 C 方向的伸缩，类似的体系还包括：
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 两端电极相同时，不会存在晶格匹配和应力问题，但这里介绍的优化方法也同样适用。
+<WRAP center info 100%>
+=== 提示 ===
+**本教程使用特定版本的QuantumATK创建，因此涉及的截图和脚本参数可能与您实际使用的版本略有区别，请在学习时务必注意。**
+</WRAP>
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   - 第二步：优化中心区域。中心区域的最优长度通常是未知的。对于周期性结构，还需要使应力最小化。但是，应力场对于器件结构来说是不唯一确定的，因此需要使用其他的方法。
-在第二步中，我们必须在确保电极扩展层内坐标不变的前提下最小化器件总能量。在ATK里至少有两种方法实现。
+在第二步中，我们必须在确保电极扩展层内坐标不变的前提下最小化器件总能量。在QuantumATK里至少有两种方法实现。
 ==== BRR方法 ====
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 ==== 1D最小化 ====
-更“暴力”的方法是将器件体系能量对内坐标和中心区域长度优化至最小，即在改变中心区域长度的同时进行整个双电极器件的计算。这是一个一维原子链最小化的问题，在每一步都针对原子位置作弛豫。因此，我们称之为 1DMIN。为此，我们发展了用 ATK 进行这种最小化的方案，使之尽可能有效地处理这个问题。但是这种方法的计算量远大于 BRR 方法，因此我们建议在对中心区域使用 BRR 弛豫之后，再进行 1DMIN 计算。
+更“暴力”的方法是将器件体系能量对内坐标和中心区域长度优化至最小，即在改变中心区域长度的同时进行整个双电极器件的计算。这是一个一维原子链最小化的问题，在每一步都针对原子位置作弛豫。因此，我们称之为 1DMIN。为此，我们发展了用 QuantumATK 进行这种最小化的方案，使之尽可能有效地处理这个问题。但是这种方法的计算量远大于 BRR 方法，因此我们建议在对中心区域使用 BRR 弛豫之后，再进行 1DMIN 计算。
 这篇教程介绍了利用 BRR 和 1DMIN 方法对电极和中心区域的弛豫。教程中的实例是用经典力场方法对银-金接触表面进行弛豫。利用经典势可以使计算更快捷，同样的方法可以适用于 DFT 计算。通常，我们会建议利用 DFT 计算来检验 ATK-Classical 计算的结果。

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