文章中报道的来自QuantumATK软件的研究结果都应该正确地引用QuantumATK软件和相关的描述方法的文章，主要是以下引用：

• Atomistix ToolKit version XXX, QuantumWise A/S (www.quantumwise.com).
• M. Brandbyge, J.-L. Mozos, P. Ordejón, J. Taylor, and K. Stokbro, Phys. Rev. B 65, 165401 (2002)（DOI）

其中XXX应该用该研究计算时采用的版本号替换。

如果计算中使用了半经验的 extended Hückel model，则文章里还应该引用以下文献：

• K. Stokbro, D. E. Petersen, S. Smidstrup, A. Blom, M. Ipsen and K. Kaasbjerg, Phys. Rev. B 82, 075420 (2010)（DOI）

如果计算中使用了DFTB（Slater-Koster）方法，则应正确引用不同参数的来源文献，详细情况请参考 QuantumATK官方手册相关章节。

如果在研究中使用了ATK-Classical方法，则应该在引用软件的一般版本和有关的文章：

• Atomistix ToolKit version XXXX.X, Synopsys QuantumWise (www.quantumwise.com)
• M. Griebel, S. Knapek and G. Zumbusch, “Numerical Simulation in Molecular Dynamics”, Springer (2007)
• M. Griebel and J. Hamaekers, Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering, 193, 1773-1788 (2004)【DOI】

如果在计算中使用了某种特定的经验势函数模型，则应添加相应的文献，详情请参考手册。

如果您在研究中使用了Virtual NanoLab，则应当正确引用VNL的软件版本：

• Virtual NanoLab version XXXX.X, Synopsys QuantumWise (www.quantumwise.com)

在2005年以前，QuantumATK的原名为TranSIESTA-C，该程序包使用了学术版的TranSIESTA（和部分的McDCal），使用的DFT方法则为与SIESTA一致的数值轨道基组。

• Mads Brandbyge, José-Luis Mozos, Pablo Ordejón, Jeremy Taylor, and Kurt Stokbro, Density-functional method for nonequilibrium electron transport, Phys. Rev. B 65, 165401 (2002).
• Kurt Stokbro, Jeremy Taylor, Mads Brandbyge, and Pablo Ordejón, TranSIESTA: A Spice for Molecular Electronics, Ann NY Acad Sci 1006, 212-226 (2003).
• José M Soler, Emilio Artacho, Julian D Gale, Alberto García, Javier Junquera, Pablo Ordejón, and Daniel Sánchez-Portal, The SIESTA method for ab initio order-N materials simulation, J. Phys. Condens. Matter 14, 2745-2779 (2002).
• Jeremy Taylor, Hong Guo, and Jian Wang, Ab initio modeling of quantum transport properties of molecular electronic devices, Phys. Rev. B 63, 245407 (2001).

• Ann E Mattsson, Peter A Schultz, Michael P Desjarlais, Thomas R Mattsson, and Kevin Leung, Designing meaningful density functional theory calculations, Modelling Simul. Mater. Sci. Eng. 13, R1 (2005).
• K. Stokbro, J. Taylor, M. Brandbyge, and H. Guo, Ab-initio Non-Equilibrium Green's Function Formalism for Calculating Electron Transport in Molecular Devices, Lecture Notes in Physics 680, 117-151 (2005).
• Max Koentopp, Connie Chang, Kieron Burke, and Roberto Car, Density functional calculations of nanoscale conductance, Journal of Physics: Condensed Matter 20, 083203 (2008).

• D. Sholl and J. A. Steckel, Density Functional Theory. A Practical Introduction, Wiley (2011).
• S. Datta, Electronic Transport in Mesoscopic Systems, Cambride (1997).
• S. Datta, Quantum Transport: Atom to Transistor, Cambride (2005).