差别

这里会显示出您选择的修订版和当前版本之间的差别。

--- atk:动力学矩阵study_object计算硅块体的声子 [2019/10/22 21:32] – [ATK 力场] xie.congwei
+++ atk:动力学矩阵study_object计算硅块体的声子 [2019/10/22 21:45] (当前版本) – [参考] xie.congwei
@@ 行 35: / 行 35: @@
 ==== 模拟设置 ====
+在 {{:atk:calculator.png?direct&25|}} **ForceFieldCalculator** 的设置中，为硅选择一个合适的势，如 Tersoff 势 <color #00a2e8>[GdGPB91]</color> 或  Stillinger–Weber 势 <color #00a2e8>[SW85]</color>。每个势都有对应的参考文献，您应该检查确定这些势是否适合您的系统和您感兴趣的性质。
+{{ :atk:silicon_phononbandstructure_silicon-atkclassical_scripter_sw-20191022.png?600 |}}
+在 {{:atk:optimization.png?direct&25|}} **OptimizeGeometry** 的设置中，取消选项 //Fix Lattice Vectors// 弛豫晶格常数，并将 Force tolerance 和 Stress error tolerance 分别降低至 0.001 eV/Å 和 0.0001 eV/Å<sup>3</sup>。
+{{ :atk:silicon-optimizegeometry_stress-20191022.png?450 |}}
+在 {{:atk:labfloor_dynamicalmatrix1.png?direct&25|}} **DynamicalMatrix** 的设置中，保持默认设置，将自动创建一个适当大小的超胞，并启用声学求和规则。
+{{ :atk:silicon-dynamical-matrix-gui-20191022.png?450 |}}
+在 {{:atk:labfloor_phononbandstructure1.png?direct&25|}} **PhononBandstructure** 设置中，相较于参考文献 <color #00a2e8>[GdGPB91]</color>，将点增加至 100，设置 //Brillouin zone route// 为 //G, K, X, G, L, X, W, L//。
+更改输出文件名称为 ''Silicon.hdf5''，发送脚本到 {{:atk:job_manager.png?direct&25|}} **Job Manager** 并运行。在普通的台式电脑上，计算只需几秒钟。
 ==== 结果 ====
+采用 **PhononBandstructure Analyzer** 和 **DOS Analyzer** 插件，查看您的 **LabFloor** 并将声子能带结构和声子态密度可视化。下图为使用 //Tersoff_Si_2005// 势计算得到的硅声子能带结构。
+{{ :atk:ff_phonon_bs-20191022.png?600 |}}
+您还可以在日志文件中查看自动选择的超胞大小，如下所示：
+<code python>
++----------------------------------------------------------+
+| Bulk: Cartesian (Angstrom) / fractional                  |
++----------------------------------------------------------+
+Bulk
+Si    0.000000e+00  0.000000e+00  0.000000e+00    0.00000  0.00000  0.00000
+Si    1.357650e+00  1.357650e+00  1.357650e+00    0.25000  0.25000  0.25000
++------------------------------------------------------------------------------+
+| Automatically detected repetitions = [7 7 7]                                 |
++------------------------------------------------------------------------------+
++------------------------------------------------------------------------------+
+| Dynamical Matrix Study                                                       |
++------------------------------------------------------------------------------+
+| 2 task(s) will be executed.                                                  |
+|                                                                              |
+| * Bundled force calculation                                                  |
+|   Displacements: 0-10                                                        |
+| * Generate dynamical matrix from displaced forces                            |
++------------------------------------------------------------------------------+
++------------------------------------------------------------------------------+
+| Executing task 1 / 2:                                                        |
+|   Bundled force calculation                                                  |
+|   Displacements: 0-10                                                        |
+|   Log to: stdout                                                             |
++------------------------------------------------------------------------------+
++------------------------------------------------------------------------------+
+| Executing task 2 / 2:                                                        |
+|   Generate dynamical matrix from displaced forces                            |
+|   Log to: stdout                                                             |
++------------------------------------------------------------------------------+
+</code>
 ===== 参考 =====
+  * 英文原文：https://docs.quantumatk.com/tutorials/dynamical_matrix/dynamical_matrix.html
+  * [GdGPB91]	(1, 2) Paolo Giannozzi, Stefano de Gironcoli, Pasquale Pavone, and Stefano Baroni. Ab initio calculation of phonon dispersions in semiconductors. //Phys. Rev. B//, 43:7231–7242, 1991. [[http://dx.doi.org/10.1103/PhysRevB.43.7231|doi:10.1103/PhysRevB.43.7231]].
+  * [SW85]	F. H. Stillinger and T. A. Weber. Computer simulation of local order in condensed phases of silicon. //Phys. Rev. B//, 31:5262–5271, Apr 1985. [[http://dx.doi.org/10.1103/PhysRevB.31.5262|doi:10.1103/PhysRevB.31.5262]].

费米维基

用户工具

站点工具

差别

页面工具