atk:创建分子结
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创建分子结
在本教程中，您将学习如何用 VNL 的 Builder 构建嵌入两个金（111）表面间的著名分子结之一：二硫杂环戊二烯-苯，即 DTB （有时也被称为苯二硫醇，BDT）。
注意
接下来的工作流程介绍将引导您对 Builder 中各种工具有相当全面的了解。对本例中表面和分子的单个操作不是特定的，而是可以应用于任何其他分子或类似结构。这就是 Builder 的思路—通过通用操作的特异序列，您可以轻松地构建甚至是高度专业化的结构。
- 构建分子。（如果您在数据库或外部文件里已经准备好时，这步就很简单；本例我们将在苯的基础上做修改，使之成为 DTB）
- 构件表面，通过分开块状晶体并创建副本，制作两个电极。
- 将分子放在左侧电极的表面，并将右侧电极连接到分子上。
- 完成器件构形。
下面的说明可能会显得有些复杂，因为每一步都包含许多操作，但通过一些培训，整个过程可以控制在 5 分钟内完成。另外，请谨记：如果您在以下步骤的任何地方出错，可使用 Undo 撤销（Ctrl + Z）！
从苯到 DTB：构建分子
将金切割成两个表面
将分子和表面结合
将中心区域转化为器件构形
参考
atk/创建分子结.1526633936.txt.gz · 最后更改: 2018/05/18 16:58 由 xie.congwei