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atk:使用job_manager向远程服务器上提交作业

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atk:使用job_manager向远程服务器上提交作业 [2016/12/06 20:14] – [提交任务] dong.dongatk:使用job_manager向远程服务器上提交作业 [2021/12/16 11:17] (当前版本) – ↷ 链接因页面移动而自动修正 211.64.159.76
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 ===== 概述 ===== ===== 概述 =====
  
-最新的VNL-ATK 2015中的Job Manager支持设置设置远程服务器提交任务,该方法的特点是:+2015版开始,Job Manager支持设置设置远程服务器提交任务,该方法的特点是:
  
   * 安全:仅使用SSH端口的加密通信;服务器端无需后台进程,无需单独开放其他端口,有效保障安全性,特别适合公共服务器上部署计算;   * 安全:仅使用SSH端口的加密通信;服务器端无需后台进程,无需单独开放其他端口,有效保障安全性,特别适合公共服务器上部署计算;
行 38: 行 38:
 {{ :atk:vnl_vnl_rsa.png?500 |}} {{ :atk:vnl_vnl_rsa.png?500 |}}
 ==== 测试无密码登录 ==== ==== 测试无密码登录 ====
 +<WRAP center tip 100%>
 +VNL 2016版开始在Job Manager图形界面上直接提供测试诊断功能,方便易用。
 +
 +</WRAP>
 +
 +
 测试设置是否正确,可使用以下脚本尝试ssh登录是否正常(以下脚本中的key_dir、hostname、username要按实际情况修改): 测试设置是否正确,可使用以下脚本尝试ssh登录是否正常(以下脚本中的key_dir、hostname、username要按实际情况修改):
 <file python test_ssh.py> <file python test_ssh.py>
行 77: 行 83:
  
  
-===== 第二步:在VNL-ATK中添加Job Manager中添加远程服务器 =====+===== 第二步:在QuantumATK中添加Job Manager中添加远程服务器 =====
  
-目前ATK中支持Direct和PBS两种服务器提交方式:+目前QuantumATK中支持Direct和PBS两种服务器提交方式:
  
   * Direct:即服务器上没有PBS等队列系统,提交的计算直接在登录的主机上运行。这种方法常试用于单节点的服务器。   * Direct:即服务器上没有PBS等队列系统,提交的计算直接在登录的主机上运行。这种方法常试用于单节点的服务器。
-  * PBS:即VNL-ATK将通过PBS系统提交任务。+  * PBS:即QuantumATK将通过PBS系统提交任务。
  
 这里以比较复杂的PBS为例: 这里以比较复杂的PBS为例:
行 126: 行 132:
   * 勾选 Enable MKL_DYNAMIC(需测试此项的加速效果来决定是否勾选)   * 勾选 Enable MKL_DYNAMIC(需测试此项的加速效果来决定是否勾选)
  
-跨节点并行的还要注意网络选择等问题,详细情况参见[[atk:atk并行计算|ATK并行计算]]。+跨节点并行的还要注意网络选择等问题,详细情况参见[[atk:quantumatk并行计算|QuantumATK并行计算]]。
  
 </WRAP> </WRAP>
行 139: 行 145:
 ===== 提交任务 ===== ===== 提交任务 =====
  
-如果以上设置没有问题,可以尝试提交任务。+如果以上设置没有问题,可以尝试提交任务。将作业脚本发送至job manager,选择相应的队列,点击开始按钮即可开始提交计算。 
 +计算一旦开始排队或运行,VNL即可关闭,并断开网络连接。下次连接时,VNL会自动检测作业进度并下载文件
  
 ==== 自定义任务的计算设置 ==== ==== 自定义任务的计算设置 ====
行 157: 行 164:
 </WRAP> </WRAP>
  
 +==== 问题排除 ====
  
  
 提交任务遇到问题时,需要针对具体问题编辑设置。 提交任务遇到问题时,需要针对具体问题编辑设置。
  
-提交任务的PBS脚本的详细设置请参考:[[atk:通过命令行方式手动提交ATK计算|通过命令行方式手动提交ATK计算]]。+提交任务的PBS脚本的详细设置请参考:[[atk:通过命令行方式手动提交ATK计算|通过命令行方式手动提交QuantumATK计算]]。
  
  
atk/使用job_manager向远程服务器上提交作业.1481026477.txt.gz · 最后更改: 2016/12/06 20:14 由 dong.dong

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