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adf:xps2020

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adf:xps2020 [2020/12/02 14:54] – [2,$E_{Hole}$计算参数设置] liu.junadf:xps2020 [2022/01/20 19:55] (当前版本) – [二、$C_2$的1S电子对应的XPS峰] liu.jun
行 2: 行 2:
 文献资料:[[http://aip.scitation.org/doi/10.1063/1.4974841|C. Grazioli, O. Baseggio, M. Stener, G. Fronzoni, M. de Simone, M. Coreno, A. Guarnaccio, A. Santagata, and M. D’Auria, Study of the electronic structure of short chain oligothiophenes, J. Chem. Phys. 146, 054303 (2017)]] 文献资料:[[http://aip.scitation.org/doi/10.1063/1.4974841|C. Grazioli, O. Baseggio, M. Stener, G. Fronzoni, M. de Simone, M. Coreno, A. Guarnaccio, A. Santagata, and M. D’Auria, Study of the electronic structure of short chain oligothiophenes, J. Chem. Phys. 146, 054303 (2017)]]
  
-XANES和EXAFS研究的是内层电子激发到空轨道,而XPS是内层电子激发到真空中,脱离分子。因此实际上计算思路是:计算该分子的单点,得到能量$E_{SP}$;去掉一个要被激发的电子(例如内层1S电子),计算该分子的能量$E_{Hole}$$E_{Hole}$-$E_{SP}$即对应的XPS峰位置。+XANES和EXAFS研究的是内层电子激发到空轨道,而XPS是内层电子激发到真空中,脱离分子。因此实际上计算思路是:计算该分子的单点,得到能量E<sub>SP</sub>;去掉一个要被激发的电子(例如内层1S电子),计算该分子的能量E<sub>Hole</sub>E<sub>Hole</sub>-E<sub>SP</sub>即对应的XPS峰位置。
  
 本例使用AMS2019.301完成计算。 本例使用AMS2019.301完成计算。
行 24: 行 24:
    9.H        -3.758005   -2.027572    0.000000    9.H        -3.758005   -2.027572    0.000000
 </code> </code>
-=====一、$C_1$的1S电子对应的XPS峰===== +=====一、C_1的1S电子对应的XPS峰===== 
-====1,$E_{SP}$计算参数设置=====+====1,E_SP计算参数设置=====
 这里我们选择BP泛函,并选择相对论方法Scalar,因为关心总能量的数值,因此基组设置的较大(TZP),并设置冻芯级别为Small(注意不能选择None) 这里我们选择BP泛函,并选择相对论方法Scalar,因为关心总能量的数值,因此基组设置的较大(TZP),并设置冻芯级别为Small(注意不能选择None)
  
 {{ :adf:2020xps02.png?600 }} {{ :adf:2020xps02.png?600 }}
  
-$C_1$原子设置为一个分区,设置方法参考:[[adf:creatregion]]+C<sub>1</sub>原子设置为一个分区,设置方法参考:[[adf:creatregion]]
  
 {{ :adf:xps03.png?600 }} {{ :adf:xps03.png?600 }}
  
-单独为$C_1$原子设定高精度基组、并设定不冻芯(必须设定为不冻芯)+单独为C<sub>1</sub>原子设定高精度基组、并设定不冻芯(必须设定为不冻芯)
  
 {{ :adf:xps04.png?600 }} {{ :adf:xps04.png?600 }}
行 44: 行 44:
 <Dec08-2019> <21:23:38>   Bond Energy       -1222.50       kcal/mol <Dec08-2019> <21:23:38>   Bond Energy       -1222.50       kcal/mol
 </code> </code>
-这就是$E_{SP}$+这就是E<sub>SP</sub>
  
-另外我们通过SCM → Output → Properties → Orbital Energies per Irrep查看能级,可以看到AA不可约表示总共28个电子,AAA不可约表示总共8个电子。我们需要激发出去的内层电子,可以在SCM → Level里面看看,例如本文中能量最低的那个轨道对应的实际上是$C_1$的1s轨道,因为其他C的1s轨道被冻结起来了,这里不会显示出来,其编号为1 AA:+另外我们通过SCM → Output → Properties → Orbital Energies per Irrep查看能级,可以看到AA不可约表示总共28个电子,AAA不可约表示总共8个电子。我们需要激发出去的内层电子,可以在SCM → Level里面看看,例如本文中能量最低的那个轨道对应的实际上是C<sub>1</sub>的1s轨道,因为其他C的1s轨道被冻结起来了,这里不会显示出来,其编号为1 AA:
  
 {{ :adf:xps07.png?600 }} {{ :adf:xps07.png?600 }}
  
 因此,我们如果要激发的就是AA不可约表示的第1个轨道的电子到真空中去,后面的计算需要这个信息。 因此,我们如果要激发的就是AA不可约表示的第1个轨道的电子到真空中去,后面的计算需要这个信息。
-====2,$E_{Hole}$计算参数设置=====+====2,E_Hole计算参数设置=====
 在上一步的基础上,修改参数如下: 在上一步的基础上,修改参数如下:
 因为去掉了AA不可约表示的第1个电子,所以体系带一个正电,自旋极化(未配对电子数)为1,同时需要勾选Unrestricted: 因为去掉了AA不可约表示的第1个电子,所以体系带一个正电,自旋极化(未配对电子数)为1,同时需要勾选Unrestricted:
行 69: 行 69:
 表示AA不可约表示α自旋14个电子依次填充在最低的14个轨道,β电子第一个轨道是空的,往上的13个轨道各占据1各电子;AAA不可约表示α和β各4各电子从低到高依次填充。这样相当于AA不可约表示的第1个轨道的电子被激发到真空中去了。 表示AA不可约表示α自旋14个电子依次填充在最低的14个轨道,β电子第一个轨道是空的,往上的13个轨道各占据1各电子;AAA不可约表示α和β各4各电子从低到高依次填充。这样相当于AA不可约表示的第1个轨道的电子被激发到真空中去了。
  
-另存任务,并运算,logfile尾部:+**另存任务,并运算**,logfile尾部:
 <code bash> <code bash>
 <Dec08-2019> <21:41:46>   Bond Energy           8.72959099 a.u. <Dec08-2019> <21:41:46>   Bond Energy           8.72959099 a.u.
行 75: 行 75:
 <Dec08-2019> <21:41:46>   Bond Energy        5477.90       kcal/mol <Dec08-2019> <21:41:46>   Bond Energy        5477.90       kcal/mol
 </code> </code>
-这就是$C_1$$E_{Hole}$+这就是C<sub>1</sub>E<sub>Hole</sub>
  
-$E_{Hole}$ $E_{SP}$ = 237.54425704 eV - (-53.01261285 eV) = 290.56 eV,文献中实验值为290.60 eV +E<sub>Hole</sub> E<sub>SP</sub> = 237.54425704 eV - (-53.01261285 eV) = 290.56 eV,文献中实验值为290.60 eV 
-=====二、$C_2$的1S电子对应的XPS峰===== +=====二、C_2的1S电子对应的XPS峰===== 
-类似计算得到$C_2$的XPS峰值:290.2948717 eV,文献中实验值为290.35 eV。文献中实验位移量为0.25 eV,这里我们计算得到0.27 eV。+类似计算得到C<sub>2</sub>的XPS峰值:290.2948717 eV,文献中实验值为290.35 eV。文献中实验位移量为0.25 eV,这里我们计算得到0.27 eV。
  
adf/xps2020.1606892069.txt.gz · 最后更改: 2020/12/02 14:54 由 liu.jun

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