adf:vdd
差别
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| adf:vdd [2016/05/17 15:35] – liu.jun | adf:vdd [2022/05/18 10:03] (当前版本) – [ADF中的VDD] liu.jun | ||
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| - | ======如何使用VDD电荷，分析片段相互作用时电荷的转移情况====== | + | ======如何使用VDD电荷，分析片段相互作用时的电荷迁移====== |
| ======VDD电荷物理含义====== | ======VDD电荷物理含义====== | ||
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| =====ADF中的VDD===== | =====ADF中的VDD===== | ||
| - | 计算完毕之后，SCM > View > properties > Atom Info > | + | 计算完毕之后，SCM |
| - 第一项表示整个分子中，每个原子上分布的VDD电量，但定义较为复杂。例如水分子中的H（一个键），约为－0.35（如果是－0.5，则表示该H原子没有净电荷，－0.35表示该H原子净电荷0.15）；水分子中的O（两个键），约为0.70（如果是1.00则表示该O原子不带净电荷，0.70表示该O原子带净电荷－0.3）；CH4中C（四个键）约为1.9（如果是2.0则表示不带净电荷，1.9表示该C原子带净电荷－0.1） | - 第一项表示整个分子中，每个原子上分布的VDD电量，但定义较为复杂。例如水分子中的H（一个键），约为－0.35（如果是－0.5，则表示该H原子没有净电荷，－0.35表示该H原子净电荷0.15）；水分子中的O（两个键），约为0.70（如果是1.00则表示该O原子不带净电荷，0.70表示该O原子带净电荷－0.3）；CH4中C（四个键）约为1.9（如果是2.0则表示不带净电荷，1.9表示该C原子带净电荷－0.1） | ||
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| 因此： | 因此： | ||
| - | * 要计算分子、二聚体、三聚体……中每个原子的净电荷，就不需要设置片段，直接进行单点计算，SCM > View > properties > Atom Info > VDD Charge即对应该原子的带电量——实际上此时是以单个原子为片段的，也就是对比（超）分子中每个原子的净电荷与这些原子孤立存在的时候的净电荷（约为0，之所以是“约”，是因为空间划分的缘故——不是整个无限大的空间）之间的差值，这样当然就是（超）分子中每个原子的净电荷 | + | * 要计算分子、二聚体、三聚体……中每个原子的净电荷，就不需要设置片段，直接进行单点计算，SCM |
| - | * 要计算片段组合成二聚体、三聚体“之前”与“之后”，片段中原子的净电荷变化量，那么进行标准的片段分析，具体参考[[adf: | + | * 要计算片段组合成二聚体、三聚体“之前”与“之后”，片段中原子的净电荷变化量，那么进行标准的片段分析，具体参考[[adf: |
| - | * 基于上述原因，一般使用第三项进行分析，第一、二项很少使用 | + | * 基于上述原因，一般使用VDD Charge。VDD（SCF term）、VDD（initial term）使用不太多。 |
adf/vdd.1463470519.txt.gz · 最后更改: 2016/05/17 15:35 由 liu.jun