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adf:vdd [2016/05/11 14:51] – [VDD电荷物理含义] liu.jun | adf:vdd [2022/05/18 10:03] (当前版本) – [ADF中的VDD] liu.jun | ||
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- | ======如何进行VDD电荷分析====== | + | ======如何使用VDD电荷,分析片段相互作用时的电荷迁移====== |
======VDD电荷物理含义====== | ======VDD电荷物理含义====== | ||
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- | Q< | + | Q< |
可以使用VDD电荷分析两个分子片段之间的化学键。在其他文献中((C. Fonseca Guerra, F. M. Bickelhaupt, | 可以使用VDD电荷分析两个分子片段之间的化学键。在其他文献中((C. Fonseca Guerra, F. M. Bickelhaupt, | ||
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=====ADF中的VDD===== | =====ADF中的VDD===== | ||
- | 计算完毕之后,SCM > View > properties > Atom Info > | + | 计算完毕之后,SCM |
- 第一项表示整个分子中,每个原子上分布的VDD电量,但定义较为复杂。例如水分子中的H(一个键),约为-0.35(如果是-0.5,则表示该H原子没有净电荷,-0.35表示该H原子净电荷0.15);水分子中的O(两个键),约为0.70(如果是1.00则表示该O原子不带净电荷,0.70表示该O原子带净电荷-0.3);CH4中C(四个键)约为1.9(如果是2.0则表示不带净电荷,1.9表示该C原子带净电荷-0.1) | - 第一项表示整个分子中,每个原子上分布的VDD电量,但定义较为复杂。例如水分子中的H(一个键),约为-0.35(如果是-0.5,则表示该H原子没有净电荷,-0.35表示该H原子净电荷0.15);水分子中的O(两个键),约为0.70(如果是1.00则表示该O原子不带净电荷,0.70表示该O原子带净电荷-0.3);CH4中C(四个键)约为1.9(如果是2.0则表示不带净电荷,1.9表示该C原子带净电荷-0.1) | ||
行 62: | 行 62: | ||
因此: | 因此: | ||
- | * 要计算分子、二聚体、三聚体……中每个原子的净电荷,就不需要设置片段,直接进行单点计算,SCM > View > properties > Atom Info > VDD Charge即对应该原子的带电量——实际上此时是以单个原子为片段的,也就是对比(超)分子中每个原子的净电荷与这些原子孤立存在的时候的净电荷(约为0,之所以是“约”,是因为空间划分的缘故——不是整个无限大的空间)之间的差值,这样当然就是(超)分子中每个原子的净电荷 | + | * 要计算分子、二聚体、三聚体……中每个原子的净电荷,就不需要设置片段,直接进行单点计算,SCM |
- | * 要计算片段组合成二聚体、三聚体“之前”与“之后”,片段中原子的净电荷变化量,那么进行标准的片段分析,具体参考[[adf: | + | * 要计算片段组合成二聚体、三聚体“之前”与“之后”,片段中原子的净电荷变化量,那么进行标准的片段分析,具体参考[[adf: |
- | * 基于上述原因,一般使用第三项进行分析,第一、二项很少使用 | + | * 基于上述原因,一般使用VDD Charge。VDD(SCF term)、VDD(initial term)使用不太多。 |