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adf:slurm

使用SLURM的集群的设置

需要修改adf201*.*/bin/start:

  • ADF2017的intelmpi版,约211行“mpirun -bootstrap slurm”改为“srun”
  • ADF2014的intelmpi版,约250行“mpirun -bootstrap slurm”改为“srun”

在adf201*.*/adfbashrc.sh最后加一行:

export I_MPI_PMI_LIBRARY=/usr/lib64/libpmi.so

当然要注意/usr/lib64/libpmi.so确实存在。

2019版不需要修改什么,可以直接使用。如果有问题,可以换OpenMPI版AMS2019试试看:

提交任务

yhbatch -p A -N B -n C ./*.run

其中

  1. A为队列名,是计算中心管理员为您提供的,一般为一串字母
  2. B本次计算使用几个节点
  3. C本次使用多少核

例如yhbatch -p PKU -N 2 -n 8 ./CH4.run,表示用户的队列名为PKU,本次计算使用2个节点共8核,任务的run文件在当前目录,为CH4.run

adf/slurm.txt · 最后更改: 2019/07/16 17:24 由 liu.jun

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