这是本文档旧的修订版!
势能面扫描,是AMS驱动的,各个模块使用起来,除了各个方法本身的参数(也就是Main窗口的设置)之外,其他参数设置是一样的。因此其他模块的PES使用,也可以参考本教程。
简单的势能面扫描,任务类型选择PES Scan,并选择合适的力场:
选中要扫描的键长或键角、二面角。注意,对键角、二面角,选择原子需要按顺序选择,例如对键角而言,第二个被选中的原子是角的顶点。然后右侧选择distance(键长)或angle(键角)、dihedral(二面角)前面的加号,然后设置扫描范围:
SC-1表示第一个扫描条件,设置该扫描条件,扫描的点数为10。如果有多个扫描条件,也可以类似设置:
保存并运行任务。