adf:peda能量各项的含义
差别
| 后一修订版 | 前一修订版 |
| adf:peda能量各项的含义 [2016/03/24 13:36] – 创建 liu.jun | adf:peda能量各项的含义 [2022/07/09 12:53] (当前版本) – [其他更详细划分] liu.jun |
|---|
| ======pEDA能量各项的含义====== | ======pEDA能量各项的含义====== |
| |
| PEDA的分解方式和分子中的分解方式很类似。分子的能量分解物理意义，可以参考[[adf:文献重现_adenine_thymine碱基对的氢键分析|]]： | PEDA的分解方式和分子中的分解方式很类似。 |
| |
| △E<sub>int</sub> =△E<sub>elstat</sub> +△E<sub>Pauli</sub>+△E<sub>oi</sub>**（+△E<sub>disp</sub>）**。 | △E<sub>int</sub> =△E<sub>elstat</sub> +△E<sub>Pauli</sub>+△E<sub>oi</sub>**（+△E<sub>disp</sub>）**。 |
| |
| * △E<sub>int</sub>表示总的结合能（对应*.out文件中的E_int） | * △E<sub>int</sub>表示总的结合能（对应*.out文件中的E_int） |
| * △E<sub>elstat</sub>表示总的结合能中，静电部分贡献（对应*.out文件中的E_elstat） | * △E<sub>elstat</sub>：单体结构已经完成“形变准备”（即单体已经从自由状态的结构调整成了二聚体中的结构），但各自的电子密度还维持在单体时的状态，这时候，单体本身局部带电，这些局部静电分布，使得单体和单体之间存在静电相互作用。通常是吸引作用（否则无法形成二聚体）。因此离子体系的静电作用项很大。 |
| * △E<sub>Pauli</sub>表示总的结合能中，Pauli排斥的贡献（对应*.out文件中的E_Pauli） | * △E<sub>Pauli</sub>：单体放在一起的时候，单体的占据轨道彼此互相排挤。不仅在空间上互相排挤，在能级上也会互相排挤，形成新的两个分子轨道。Pauli排斥是占据轨道之间的相互作用，可以用轨道重叠积分(参考[[adf:sfo-overlap]])来分析轨道之间Pauli排斥的大小关系(对一个特定体系来说，轨道重叠越大，对Pauli排斥贡献越大)。空间位阻，大部分情况是由于Pauli排斥导致的。 |
| * △E<sub>oi</sub>表示总的结合能中，轨道相互作用的贡献（对应*.out文件中的E_orb） | * △E<sub>oi</sub>：一个单体的占据轨道和另一个单体的空轨道在一起，组合出新的、整个二聚体占据轨道和空轨道。新的二聚体的占据轨道，既有原先A单体的占据轨道，也含有B单体的空轨道，那么客观上就是A单体占据轨道上的电子，少量的转移到了B单体的空轨道上。转移了多少？取决于该二聚体的占据轨道中B单体空轨道的权重，权重越大，转移越多。实际上这一项是表征共价作用的强弱的。这一项越大，表示共价作用越强。 |
| *** △E<sub>disp</sub>表示色散能，如果没有使用色散修正泛函的话，这一项不存在。** | *** △E<sub>disp</sub>表示色散能，如果没有使用色散修正泛函的话，这一项不存在。** |
| |
| E_int=E_elstat+E_Pauli+E_orb | E_int=E_elstat+E_Pauli+E_orb |
| |
| 上面E_orb，细分为T_orb、Elst_orb、XC_orb，也就是轨道相互作用，对动能T、静电作用能Elst、交换相关能的贡献； | |
| | =====其他更详细划分===== |
| | 一般不太关心这些数据。上面E_orb，细分为T_orb、Elst_orb、XC_orb，也就是轨道相互作用，对动能T、静电作用能Elst、交换相关能的贡献； |
| |
| 与轨道无关的部分有两种成分：E_elstat、E_Pauli是与轨道相互作用无关的部分。注意静电作用能既包括与轨道作用有关的部分，也包括与轨道作用无关的部分； | 与轨道无关的部分有两种成分：E_elstat、E_Pauli是与轨道相互作用无关的部分。注意静电作用能既包括与轨道作用有关的部分，也包括与轨道作用无关的部分； |
adf/peda能量各项的含义.1458797795.txt.gz · 最后更改: 2016/03/24 13:36 由 liu.jun
