adf:openmpin2019

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--- adf:openmpin2019 [2019/11/14 22:00] – 创建 liu.jun
+++ adf:openmpin2019 [2024/04/14 22:45] (当前版本) – liu.jun
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-======AMS2019中，ReaxFF单进程为何CPU占用率变成了800%左右======
+======AMS2019以后的版本中，ReaxFF单进程为何CPU占用率变成了800%左右======
-Starting from AMS2019, ReaxFF has become multithreaded. If the user wishes to limit ReaxFF execution to one core they should set the OMP_NUM_THREADS environment variable to 1. This variable is set automatically to a proper value when using Intel-MPI binaries with a supported batch system on Linux (SLURM, PBS, etc.). In all other cases ReaxFF will try to use all cores available in the machine.
+MPI和OpenMP是两种不同的并行计算机制，在旧版本中，只有MPI并行，没有OpenMP并行。从AMS2019开始，ReaxFF在原先MPI并行的基础上，增加了OpenMP并行，效率提高了一个数量级，但其核数占用，是另一套机制，也就是NSCM设置为某个数值的时候，OpenMP也会调用更多的核数（默认情况下，会调用所有核）。如果用户希望降低单个任务的CPU占用率，可以新增环境变量OMP_NUM_THREADS，赋值为1（取消OpenMP并行，或者到一个比较低的自然数，例如2、4）。
+Linux、Intel-MPI版通过PBS、Slurm、LSF提交的情况，不需要设置该变量，它会自动调整到一个合适的值上。
+  * Windows的环境变量修改方法，参考：[[adf:env_win|如何设置环境变量？]]
+  * Linux的环境变量设置，是在ams20*/amsbashrc.sh中增加一行，例如export OMP_NUM_THREADS=1，退出重新登入，即可生效。

adf/openmpin2019.1573740042.txt.gz · 最后更改: 2019/11/14 22:00 由 liu.jun

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