下图，应该能够非常清晰的理解差异所在： 该图是同一个计算（CH4单点计算，因此默认每个原子为一个片段，因此SFO就是原子轨道），唯一的差别仅在于左边的计算，坐标轴沿着C-H键，原点在C原子；右边的计算坐标系较为任意，两个窗口显示的是同一个编号的SFO（即同一个原子轨道，即C的Px轨道）。

解释如下：对于原子而言，不同的坐标轴朝向，实际上原子的轨道相对于其他原子的轨道，朝向是不同的，从而导致2个轨道重叠积分的值不同。

可以理解为ADF在朝向方面不够灵活。这个现象在EDA-NOCV中也存在，对于对称的配合物，如果金属中心不是原点，高转动轴不在z轴（或其他轴）上，而是任意朝向，则NOCV轨道图也是歪的。

因此，建议您计算的时候，都在View中，当前坐标轴下，看一下各个SFO的方向，是不是理想的方向。