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adf:moleculargun1

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adf:moleculargun1 [2019/12/10 14:40] – [设置Molecular Gun] liu.junadf:moleculargun1 [2019/12/18 22:57] (当前版本) – [添加入射水分子] liu.jun
行 2: 行 2:
  
 本文说明,如何使用ReaxFF的Molecular Gun功能模拟在二维表面,原子、分子以一定频率、速度(即温度)从外界入射到二维表面,在表面沉积、反应或凝聚的过程。此处以水分子在石墨烯表面的行为为例进行说明。 本文说明,如何使用ReaxFF的Molecular Gun功能模拟在二维表面,原子、分子以一定频率、速度(即温度)从外界入射到二维表面,在表面沉积、反应或凝聚的过程。此处以水分子在石墨烯表面的行为为例进行说明。
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-ADF2016.208及其以后的版本,包含该功能(注:该功能ADF2017正式发布,目前只是最新的开发测试版包括这个功能)。下载链接(编号大于r57000即可。试用或者能免费升级到2017的用户,需要邮件告知我们,才能取得2017license,因为2017版尚未正式发布,预计4月发布):https://www.scm.com/support/downloads/bug-fixes/ 
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-[[https://www.jianguoyun.com/p/DX0xiMIQmZ2ZBhiHryc|本例演示计算输入输出文件下载]] 
 =====石墨烯建模 ===== =====石墨烯建模 =====
 二维表面的建模,参考费米维基:[[adf:moleculesonsurface]]中“**创建固体表面**”。本文中创建石墨烯的过程如下: 二维表面的建模,参考费米维基:[[adf:moleculesonsurface]]中“**创建固体表面**”。本文中创建石墨烯的过程如下:
行 31: 行 27:
 =====添加入射水分子===== =====添加入射水分子=====
  
-View - Periodic - Show Unit Cell显示盒子。在适当的位置添加一个水分子基本的分子建模,参考费米维基:[[https://www.jianguoyun.com/p/Dfq5zjUQmZ2ZBhjprSc|建模:ADF模块分子的基本建模功能演示(视频)]])+View - Periodic - Show Unit Cell显示盒子。在适当的位置添加一个水分子基本的分子建模,参考{{ :adf:creatmolecule.rar |AMS的基本建模功能(视频) }}
  
 {{ :adf:moleculargun1_06.png?650 }} {{ :adf:moleculargun1_06.png?650 }}
行 70: 行 66:
  
 {{ :adf:moleculargun1_11.png?400 }} {{ :adf:moleculargun1_11.png?400 }}
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-形成很大的水簇: 
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-{{ :adf:moleculargun1_12.png?400 }} 
  
 注意:本例中Cell在xy方向尺寸不大,所以继续增大水簇,可能会形成连片的水膜。读者有兴趣,可以增大Steps数继续模拟。本例只进行了40万步,步长为0.25fs。 注意:本例中Cell在xy方向尺寸不大,所以继续增大水簇,可能会形成连片的水膜。读者有兴趣,可以增大Steps数继续模拟。本例只进行了40万步,步长为0.25fs。
adf/moleculargun1.1575960042.txt.gz · 最后更改: 2019/12/10 14:40 由 liu.jun

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