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两侧同时换到之前的修订记录前一修订版后一修订版 | 前一修订版 | ||
adf:mdmc [2019/02/25 11:27] – liu.jun | adf:mdmc [2020/05/21 15:25] (当前版本) – [注意] liu.jun | ||
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行 8: | 行 8: | ||
- | 在常规的分子动力学模拟之外,增加设置如下: | + | 在常规的分子动力学模拟(软件使用中文教程参考:[[adf: |
- | {{ :adf:reaxffmdmc01.jpg |}} | + | {{ :adf:reaxffmdmc02.png? |
**这三个参数的含义:** | **这三个参数的含义:** | ||
行 17: | 行 17: | ||
* Number of fbMC steps,即每次MC运行的步数 | * Number of fbMC steps,即每次MC运行的步数 | ||
* Max atom displacement,即MC每一步之间原子的最大位移量 | * Max atom displacement,即MC每一步之间原子的最大位移量 | ||
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=====注意===== | =====注意===== | ||
- | - 分子间的反应,Frequency of fbMC steps设置的小一些好一些,例如300,Number of fbMC steps也设置差不多的数值,例如300或200、100,这个值越大,发生反应的可能性也变大 | + | - 分子间的反应,Frequency of fbMC steps设置的小一些好一些,例如300,Number of fbMC steps也设置差不多的数值,例如300或200、100,这个值越小,发生反应的可能性也变大 |
- | - Max atom displacement,这个值越大,相当于“温度”越高,但没有很明确的对应关系,用户可以在模拟过程中测试不同的值,但一般都大于0.1 | + | - Max atom displacement,这个值越大,相当于“温度”越高,但没有很明确的对应关系,用户可以在模拟过程中测试不同的值,但一般都大于0.1。选取这个值的原则是:可以尽量大,越大加速效果越显著,但另一个原则是,整个分子系统不能崩溃 |
- 动画过程不显示MC的轨迹,因此如果Number of fbMC steps比较大,动画里面会有间歇性的“跳变”,这是因为跳过了MC的“帧” | - 动画过程不显示MC的轨迹,因此如果Number of fbMC steps比较大,动画里面会有间歇性的“跳变”,这是因为跳过了MC的“帧” |