adf:isotop

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--- adf:isotop [2019/12/04 22:37] – liu.jun
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-====== 如何计算同位素引起的红外谱的位移 ======
-简单起见，我们以水分子为例，展示ADF如何计算同位素引起的红外谱的位移（ADF2014.07以后的版本具有此功能），本教程使用AMS2019.301制作。
-步骤如下：
-第一步：[[adf:geoopt]]：
-{{ :adf:isotopinadf01.jpg?650 }}
-结构优化更详细的参数选择，参考费米维基：“[[adf:geoopt]]”
-第二步：基于第一步优化得到的几何结构，计算红外谱：
-{{ :adf:isotopinadf02.jpg?650 }}
-更详细的参数设置参考费米维基：“[[adf:ir]]”。
-计算同位素引起的位移需要添加的额外设置：
-{{ :adf:isotopinadf03.jpg?650 }}
-语句IsotopicShift 2=2 3=2的含义：
-第2,3个原子的相对质量为2，在本例中，第2,3个原子也就是H原子：
-{{ :adf:isotopinadf04.jpg?650 }}
-如此也就是设置了水分子中的H为氘。
-第三步：File-Save as保存任务（注意保存任务要避免文件夹、路径、文件名带有中文字符或者空格），并运行File-Run（投递任务的其他方式参考费米维基：“[[adf:maintance|ADF如何提交并行计算任务]]”）
-第四步，查看结果：
-{{ :adf:isotopinadf05.jpg?650 }}
-如此则打开文本格式的输出文件，在out文件的窗口下方输入Iso（不区分大小写），搜到输出文件中关于同位素引起红外谱位移的部分，如下：
-{{ :adf:isotopinadf06.jpg?650 }}
-注意：对于原子数大于2的分子，前面6个频率是关于平动的，和振动无关，实际有意义的，是第7个频率及其之后的频率。因此水分子中氘（此例中两个H原子都为氘）引起的红外谱的偏移如上图红色方框内所示，分别为-380.83 cm<sup>-1</sup>、-1072.66 cm<sup>-1</sup>、-1059.57 cm<sup>-1</sup>，也即水分子中H全部替换为氘之后，红外振动的波数分别少425.31、1003.36、987.98。
-查看没有同位素引起位移的原始的红外谱：
-{{ :adf:isotopinadf07.jpg?650 }}
-{{ :adf:isotopinadf08.jpg?650 }}
-注意该图谱中没有显示前面6个关于平动的频率，平动的频率只是一个纯数学的数字，在实验上不会观察到，因此不必去理会。
-AMS软件提供**免费试用**（一般为一个月），试用申请方式参见**：[[adf:trial|]]**

adf/isotop.1575470261.txt.gz · 最后更改: 2019/12/04 22:37 由 liu.jun

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