adf:ircofadf
差别
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| adf:ircofadf [2019/12/04 19:33] – [前提] liu.jun | adf:ircofadf [2020/11/13 19:13] (当前版本) – 移除 liu.jun | ||
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| 行 1: | 行 1: | ||
| - | ======如何计算内反应路径IRC====== | ||
| - | =====前提===== | ||
| - | 用户已经完成过渡态搜索，得到过渡态结构。IRC会分别得到从过渡态结构出发，沿着反应物、产物方向的变化路径，共同的起点是过渡态结构。本例以$CH_4-F_2$取代反应的过渡态为例，计算IRC。 | ||
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| - | =====参数设置===== | ||
| - | 泛函、基组、精度设置应该与过渡态搜索一致，便于比较在相同参数下的能量变化。过渡态搜索、IRC计算，参数标准可以采用结构优化相同精度的参数。 | ||
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| - | IRC计算，需要设置的参数非常少，分子结构为过渡态结构，Main面板选择IRC以及正确的基组、泛函等参数，这里为了示范，所以选择了较小的基组DZP，并且设置了Frozen core为large。具体参考：[[adf: | ||
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| - | {{ : | ||
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| - | IRC的详细参数，需要设置的也不多，默认勾选了“Forward path”和“Backward path”，这表示从过渡态结构到反应物、产物两端的路径都要计算，但注意：Forward path、Backward path，与反应物、产物并没有一一对应的关系，因为对程序来说，反应物也可以是产物，产物也可以是反应物。 | ||
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| - | {{ : | ||
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| - | <color green> | ||
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| - | 计算过程中，可以使用ADF LOGO > Movie > File > open，打开*.logfile监控结构的变化。IRC实际上相当于一系列的限制性结构优化。这些优化里面，没有收敛的结构，一般我们并不关心，所以可以只显示收敛的点：Movie窗口 > View > Converged Geometries Only，如此显示较为光滑的IRC曲线： | ||
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| - | {{ : | ||
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| - | 上图蓝色框中的下滑曲线与绿色下滑曲线分别代表从过渡态结构下滑到反应物或产物的路径。 | ||
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| - | 注意：两条线实际上是不连续的，两个曲线之间的直线段可以忽略。另外，两条曲线的起点，略有数值上的差异，两条曲线可以通过外加过一个结构点（渡态结构）的能量，达到连续曲线的效果。因为过渡态结构点是两条曲线的真正的共同起点。 | ||
adf/ircofadf.1575459197.txt.gz · 最后更改: 2019/12/04 19:33 由 liu.jun