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adf:ircofadf

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adf:ircofadf [2017/11/15 16:21] – 创建 liu.junadf:ircofadf [2020/11/13 19:13] (当前版本) – 移除 liu.jun
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-======如何计算内反应路径IRC====== 
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-=====前提===== 
-用户已经完成过渡态搜索,得到过渡态结构。IRC会分别得到从过渡态结构出发,沿着反应物、产物方向的变化路径,共同的起点是过渡态结构。本例以CNH过渡态为例,计算IRC。 
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-=====参数设置===== 
-泛函、基组、精度设置应该与过渡态搜索一致,便于比较在相同参数下的能量变化。过渡态搜索、IRC计算,参数标准可以采用结构优化相同精度的参数。 
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-IRC计算,需要设置的参数非常少,分子结构为过渡态结构,Main面板选择IRC以及正确的基组、泛函等参数,这里为了示范,所以选择了较小的基组DZP,并且设置了Frozen core为large。具体参考:[[adf:parameters]] 
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-{{ :adf:irc01.png?650 }} 
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-IRC的详细参数,需要设置的也不多,默认勾选了“Forward path”和“Backward path”,这表示从过渡态结构到反应物、产物两端的路径都要计算,但注意:Forward path、Backward path,与反应物、产物并没有一一对应的关系,因为对程序来说,反应物也可以是产物,产物也可以是反应物。 
- 
-推荐设置的一个参数:Step length,这个参数是指IRC结构点的变化步长。实际上ADF2017.109之后,会自动判断step应该为多少比较合理,用户只需要设定一个上限即可。例如本例中设置的上限0.5较为合理,IRC的点不太多也不太少。这个值越小,IRC扫描的点越多。 
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-{{ :adf:irc02.png?650 }} 
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-计算过程中,可以使用ADF LOGO > Movie > File > open,打开*.logfile监控结构的变化。IRC实际上相当于一系列的限制性结构优化。这些优化里面,没有收敛的点,一般我们并不关心,所以可以只显示收敛的点:Movie窗口 > View > Converged Geometries Only,如此显示较为光滑的IRC曲线: 
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-{{ :adf:irc03.png?650 }} 
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adf/ircofadf.1510734089.txt.gz · 最后更改: 2017/11/15 16:21 由 liu.jun

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