差别

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--- adf:ir [2017/05/27 10:29] – liu.jun
+++ adf:ir [2020/11/16 20:07] (当前版本) – 移除 liu.jun
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-====== 如何计算分子的频率、红外吸收谱、零点能、转动能级、转动惯量 ======
-，[[adf:geoopt|优化分子结构]]
-，导入优化好的坐标到ADFinput中：
-打开优化任务的movie（在ADFjobs中选中该任务之后，点击SCM LOGO > movie；或在该优化任务的任何一个窗口点击SCM-movie），将最后一帧的收敛结构导出，可以用如下几种方式：
-在movie窗口，点击file > save geometry，则将该结构保存为xyz坐标格式，在计算频率的ADFinput窗口导入坐标，并设置参数如下图
-{{ :adf:frequencies01.png?600 }}
-或在movie窗口，点击file > Update Geometry In Input,则将该帧坐标更新到ADFinput窗口中，将该窗口参数更改为频率计算的参数（如上图），然后另存为频率计算的任务名字。
-，保存、运行
-，结果查看
-在该任何相关的任何窗口，或在ADFjobs中选中该任务之后，点击ADF LOGO > Spectra，即显示振动频率：
-{{ :adf:frequencies02.png?600 }}
-如果有虚频，则虚频的峰为负数，并且峰朝上，此例中没有虚频，正常的振动峰朝下。点击峰的位置，或者下方列表中计算得到的三个峰的三行，则显示该峰对应的振动模式的振动动画。
-点击ADF LOGO > Output > Other Properties > Zero-Point Energy可以看到零点能。
-在ADF logo > Output >Other properties > Intensities Collected，可以看到文本形式的输出内容，包括强度和热力学信息：
-<code bash>
- List of All Frequencies:
- Intensities
- ===========
-               Frequency       Dipole Strength        Absorption Intensity (degeneracy not counted)
-                 cm-1           1e-40 esu2 cm2          km/mole
-              ----------          ----------          ----------
-.873127          246.870556           91.450170
-.801217            6.023038            5.748677
-.433112          111.790825          110.919407
- Statistical Thermal Analysis  ***  ideal gas assumed  ***
- Pressure:                  1.000000 atm.
- Temperature:             298.150000 K
- Moments of Inertia (and direction vectors)
- ==========================================
-.9638          4.4225          6.3862
- ------------------------------------------------
-.0000          0.0000          0.0000
-.0000          0.0000          1.0000
-.0000          1.0000          0.0000
- The rotational contribution to the molecular entropy includes
- a term, dependent on the symmetry number sigma. The results
- reported below were computed using sigma = 2, determined from
- the point group symmetry of the input geometry (C(2V)).
- If this is not the correct symmetry, please contact SCM to report a bug.
- Contributions from frequencies below 20 1/cm are not included in
- the vibrational sums. Their contributions, if any, are reported separately.
-     Temp                                                       Transl     Rotat    Vibrat     Total
-     ----                                                       ------     -----    ------     -----
-.15   Entropy (cal/mole-K):                             34.608    10.415     0.013    45.037
-              Internal Energy (Kcal/mole):                       0.889     0.889    13.218    14.996
-              Constant Volume Heat Capacity (cal/mole-K):        2.981     2.981     0.081     6.043
-              Summary of energy terms
-                                                   hartree              eV         kcal/mol           kJ/mol
-                                      --------------------     -----------       ----------      -----------
-              Bond Energy:              -0.513171971770898        -13.9641          -322.02         -1347.33
-              Internal Energy:           0.023897571375166          0.6503            15.00            62.74
-              pV/n = RT:                 0.000944186013486          0.0257             0.59             2.48
-              Enthalpy H:               -0.488330214382246        -13.2881          -306.43         -1282.11
-              -T*S:                     -0.021398412274880         -0.5823           -13.43           -56.18
-              Gibbs free energy:        -0.509728626657127        -13.8704          -319.86         -1338.29
-</code>
-其中，
-  * Transl，Rotat，Vibrat，Total三项列出了298.15K时，熵、内能、热容的平移、转动、振动分量与总和。
-  * Summary of energy terms，列出了内能、焓、吉布斯自由能等信息。
-  * Moments of Inertia，转动惯量I。转动能级E<sub>rotate</sub>=h<sup>2</sup>*J(J+1)/8π<sup>2</sup>I，其中J为转动量子数也就是能级序号，I为转动惯量，h为普朗克常数。

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