这是本文档旧的修订版!
本文使用AMS2020.101完成。
用户首先要为体系分区,便于后面设定为不同分区使用不同计算引擎。我们以一个长链分子为例,其中一段-CH2-CH2-,我们希望用ADF,其余部分使用UFF力场,(其他方法组合也是类似设置)分区设置如下:
基本参数设置如下所示:
这里,我们选择的是ADF和Force Field计算引擎。点击窗口底部ADF 1、Force Field 1,分别为两个计算引擎设置详细参数:
关于Force Field计算引擎:默认使用最简单的UFF力场(当然UFF力场的Force Field Library里面有MOF材料的力场,如果需要的话,可以选择)。对UFF力场而言,默认设置就足够了。如果用户选择的是Amber、Tripos等力场,则还需要设置ForceField Charge以及ForceField Type:
设置完毕,保保存并运行任务。
本例是进行结构优化,因此在SCM - Movie中可以看到优化过程,结构的变化。
可以看到QM区域与MM区域仍然是连接在一起的(Capping的作用机制)。
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