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adf:highdensity [2023/10/24 15:34] – [创建高密度大分子固体、分子动力学压缩与拉伸的设置方法] liu.jun | adf:highdensity [2024/02/21 17:29] (当前版本) – [【入门基础教程】创建高密度大分子固体、分子动力学压缩与拉伸的设置方法] liu.jun | ||
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**分子比Builder的工作原理,是在用户指定的Cell体积内、指定的分子间距(默认值2.5埃,当然可以略微改小),随机刚性堆叠分子。如果分子形状比较长,体积比较大,或者存在比较大的扭曲,那就很难直接堆叠出用户希望的较大密度,从而堆叠失败、产生报错。** | **分子比Builder的工作原理,是在用户指定的Cell体积内、指定的分子间距(默认值2.5埃,当然可以略微改小),随机刚性堆叠分子。如果分子形状比较长,体积比较大,或者存在比较大的扭曲,那就很难直接堆叠出用户希望的较大密度,从而堆叠失败、产生报错。** | ||