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-====== 如何优化分子的几何结构 ======
-此处以氧气分子举例：优化中性<chem>O2</chem>分子：
-=====参数设置=====
-{{ :adf:o2-ea01.jpg |}}
-**注意：**
-  - O2的基态是三重态（两个电子未配对），因此Spin Polarization设为2（其他例如水分子，基态是单重态，所有电子配对，那么Spin Polarization则为默认值0）；
-  - 因为O2很小因此为了省事，直接把优化的基组设置成了TZP，实际上分子比较大的时候设置为DZP更好（省时间）；
-  - 结构优化Numerical Quality设置为Normal即可，与Good几乎没有任何差别；
-  - 然后优化结束之后，再计算single point即可。本例中对总能量很感兴趣，因此PBE的效果会好于B3LYP
-在ADFinput分别点击file-save，file-run，即运行计算。
-=====结果查看=====
-计算结束后，查看总能量：
-{{adf:o2-ea02.jpg|}}
-{{adf:o2-ea03.jpg|}}
-注意：优化过程会不断地计算不同的分子结构，直到找到最低能量的结构为止。收敛标准得到5个T表示五个收敛标准都达到。其中第二个标准最重要，一般也是最后一个达到的，第二个标准是势能面的梯度最大值。这个标准非常严格，对于大量过渡金属参与的化学反应，过渡态搜索，有可能达不到这样严格的标准，一般到0.003左右也可以认为收敛了，可以将对应的分子结构拿来使用。
-优化过程结构变化的查看：
-{{adf:o2-ea04.jpg|}}
-查看能量的变化：
-{{adf:o2-ea05.jpg|}}
-查看键长的变化：
-安住shift键，即可选择多个原子，如图所示，安住shift键，分别选中两个O原子，原子变为高亮，表示被选中。
-{{adf:o2-ea06.jpg|}}
-然后
-{{adf:o2-ea07.jpg|}}
-右方出现键长变化的图，窗口下方也会出现每一步的具体键长数值。
-注意：键角、二面角也是类似，选中对应的原子，然后选择上面的选项即可。
-如果要将某一帧（往往需要导出最后一帧）的结构导出，参考：
-  * [[adf:updategeotry]]
-到此优化过程完成！
-一般结构优化完成之后，会进行频率计算，检查是不是存在虚频。如果存在虚频，则表示优化不精确，需要继续优化。但这个问题在ADF一般很少出现。因此，对于非弱键的体系，都可以省去这一步。如果不放心，可以进行频率计算。
-ADF软件提供**免费试用**（一般为一个月），试用申请方式参见**费米科技维基百科：[[adf:trial|]]**

adf/geoopt.1520998512.txt.gz · 最后更改: 2018/03/14 11:35 由 liu.jun

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