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adf:dipolemoment

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adf:dipolemoment [2016/07/07 15:24] – [组分1] liu.junadf:dipolemoment [2023/05/09 09:23] (当前版本) – [结果查看] liu.jun
行 1: 行 1:
-======如何计算分子的电偶极矩======+======分子的电偶极矩的计算======
  
-ADF模块任何一个计算,都会自动给出分子的电偶极矩,以及分子中每个原子的电偶极矩、单极电荷。整个分子的电偶极矩可以由分子中每个原子的电偶极矩、单极电荷、原子的坐标得到。如果是多个分子形成的弱相互作用体系,也可以通过这种方式,把其中每个分子的偶极矩计算出来。以下以一个H<sub>2</sub>O为例说明,*.out文件有如下内容: +ADF模块任何一个计算,都会自动给出分子的电偶极矩,以及分子中每个原子的电偶极矩、单极电荷。整个分子的电偶极矩可以由分子中每个原子的电偶极矩、单极电荷、原子的坐标得到。如果是多个分子形成的弱相互作用体系,也可以通过这种方式,把其中每个分子的偶极矩计算出来。以下以一个H<sub>2</sub>O为例说明
-=====找到所需数据=====+
  
-**找到原子的坐标**(ADF实际上把ADFinput中输入的分子进行了转动、平移,得到偏向对称化的坐标):+=====结果查看===== 
 + 
 +**这个值在*.out文件中是可以直接找到的,程序已经自动帮我们计算好了。** 
 + 
 +{{:adf:dipolemoment01.png|}} 
 + 
 +一般情况,我们不需要自己手动计算。而且这个数字是来自拟合电子密度,因此有一点点误差,上图中第一个方框中的数值即是我们上面计算的值。第二个方框中是精确电子密度计算出来的值,二者有一点误差,但基本上可以忽略。 
 + 
 +什么时候需要手动计算呢?也就是计算多个分子之间的诱导偶极、诱导力的时候,体系是多个分子,或者多个片段,需要手动的计算出各个分子片段的偶极矩,以此计算诱导偶极、诱导力。 
 + 
 +**总结:这里计算出了电偶极矩矢量、模,以及电偶极子的中心坐标。** 
 +====数据的可视化显示==== 
 +{{ :adf:e55e6b96-92a0-4485-918c-f42ba08dc237.png?650 }} 
 +=====数据背后的计算方法===== 
 +====一、找到所需数据==== 
 +**找到原子的坐标**(ADF实际上把AMSinput中输入的分子进行了转动、平移,得到偏向对称化的坐标):
  
   FRAGMENTS   FRAGMENTS
行 23: 行 37:
     3 H      0.090160    -0.000000 -0.092555 -0.030222    -0.170094  0.000000 -0.000000  0.160764  0.076767  0.009330     3 H      0.090160    -0.000000 -0.092555 -0.030222    -0.170094  0.000000 -0.000000  0.160764  0.076767  0.009330
  
-=====计算分子偶极矩的两个组分=====+====二、计算分子偶极矩的两个组分====
          
 计算过程可以考虑使用Excel表格的计算功能。 计算过程可以考虑使用Excel表格的计算功能。
  
-====组分1====+===1,组分1===
  
 **计算所有原子的偶极矩叠加**,原子dip总和: **计算所有原子的偶极矩叠加**,原子dip总和:
行 38: 行 52:
  
 这是原子偶极总和对整个分子偶极矩的贡献。 这是原子偶极总和对整个分子偶极矩的贡献。
-====组分2====+===2,组分2===
  
 **计算原子的单极电荷对整个分子偶极矩的贡献**,也就是原子的**单极电荷**乘以各自坐标: **计算原子的单极电荷对整个分子偶极矩的贡献**,也就是原子的**单极电荷**乘以各自坐标:
行 64: 行 78:
  
 正电中心坐标和负电中心坐标,二者的均值为**电偶极子的中心**。 正电中心坐标和负电中心坐标,二者的均值为**电偶极子的中心**。
-=====计算分子的偶极矩=====+====三、计算分子的偶极矩====
  
 分子的偶极矩=dip总和+单极电荷对整个分子偶极矩的贡献: 分子的偶极矩=dip总和+单极电荷对整个分子偶极矩的贡献:
行 73: 行 87:
 单位换算为Debye:0.6677344 a.u.=0.6677344*2.542=1.6973808 Debye 单位换算为Debye:0.6677344 a.u.=0.6677344*2.542=1.6973808 Debye
  
-=====说明===== 
  
-**这个值在*.out文件中是可以直接照到的,程序已经自动帮我们计算好了。** 
- 
-{{:adf:dipolemoment01.png|}} 
- 
-一般情况,我们不需要自己手动计算。而且这个数字是来自拟合电子密度,因此有一点点误差,上图中第一个方框中的数值即是我们上面计算的值。第二个方框中是精确电子密度计算出来的值,二者有一点误差,但基本上可以忽略。 
- 
-什么时候需要手动计算呢?也就是计算多个分子之间的诱导偶极、诱导力的时候,体系是多个分子,或者多个片段,需要手动的计算出各个分子片段的偶极矩,以此计算诱导偶极、诱导力。 
- 
-**总结:这里计算出了电偶极矩矢量、模,以及电偶极子的中心坐标。** 
adf/dipolemoment.1467876248.txt.gz · 最后更改: 2016/07/07 15:24 由 liu.jun

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