这是本文档旧的修订版!
此处以简单案例进行说明:
说明:
只需要设置系综实现的方案Thermostat、Temperature、Damping constant。其中Damping constant表示震荡时间(在达到指定温度前,温度随机震荡),一般默认设置100fs,也可以降低为5fs,对结果影响不大。
温度如果只设置了一个,则不需要设置Duration(s),整个模拟过程都是该温度;如果需要改变温度,则如上图所示设置多个温度即可,配合Duration(s)的设置,可以实现控温。例如图中所示表示:298K运行5000步,然后348K运行25000步,然后回到298K直到结束。所以Duration(s)的数字个数比温度的数字个数少1个。
设置与NVT类似。
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