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adf:densitylaplace [2018/04/12 14:14] – [基础理论] liu.jun | adf:densitylaplace [2019/12/08 09:53] (当前版本) – [注意:] liu.jun | ||
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======如何通过计算拉普拉斯电子密度区分共价键和离子键====== | ======如何通过计算拉普拉斯电子密度区分共价键和离子键====== | ||
- | =====基础理论===== | + | =====前言===== |
AIM理论中的键临界点(BCP)出现在相邻的相互作用的原子之间,这个点一般被认为是描述相应两个原子相互作用的最关键的点,这个点的性质(密度、能量密度、动能密度、源函数等)常被用来讨论成键特征。 | AIM理论中的键临界点(BCP)出现在相邻的相互作用的原子之间,这个点一般被认为是描述相应两个原子相互作用的最关键的点,这个点的性质(密度、能量密度、动能密度、源函数等)常被用来讨论成键特征。 | ||
两个原子间的键临界点(BCP)的电子密度拉普拉斯值的符号为负,为共价作用;如果符号为正,为是非共价作用,如离子键、氢键、卤键、二氢键、pi-pi堆积等,本质是静电作用或范德华作用,因此成键区域没有电子密度的聚集。 | 两个原子间的键临界点(BCP)的电子密度拉普拉斯值的符号为负,为共价作用;如果符号为正,为是非共价作用,如离子键、氢键、卤键、二氢键、pi-pi堆积等,本质是静电作用或范德华作用,因此成键区域没有电子密度的聚集。 | ||
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- | 更详细说明,参考:http:// | ||
以苯为例进行说明: | 以苯为例进行说明: | ||
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=====结果查看===== | =====结果查看===== | ||
- | 点击Add > Cut plane: Colored > Select Field > Properties > Density > SCF Laplacian,之后程序开始计算拉普拉斯电子密度并显示。按住shift键选中任意三个原子,并点击“with atoms”,通过这三个原子的拉普拉斯电子密度截面图就显示出来了,如下所示: | + | 点击Add > Cut plane: Colored > Select Field > Properties > Density > Density |
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====注意: | ====注意: | ||
- | 拉普拉斯电子密度的正负值很大,将其调整到看起来比较方便的范围内,如上图(右下角,色条的范围)调整到-1.0~1.0,并勾选bar显示色条,就能够通过颜色很容易地区分出是正值还是负值(下文会用到正、负来判断化学键的类别)。 | + | 拉普拉斯电子密度的正负值很大,将其调整到看起来比较方便的范围内,尤其是正负对称的范围,例如如上图-0.51~0.51,并勾选bar显示色条,就能够通过颜色很容易地区分出是正值还是负值(下文会用到正、负来判断化学键的类别)。 |
- | 点击ADF logo > View > Properties > AIM(Bader)显示如下: | + | 点击ADF logo > View > Properties > QTAIM(Topology)显示如下: |
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