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adf:creatsurfaceofliquid

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adf:creatsurfaceofliquid [2019/12/10 16:14] liu.junadf:creatsurfaceofliquid [2024/02/05 12:33] (当前版本) liu.jun
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-=====创建均匀混合物======+=====【入门基础教程】创建均匀混合物======
  
  
-打开ADFinput,切换到ReaxFF模块: +打开AMSinput根据需要切换到ReaxFF或DFTB、BAND模块,检查周期性Periodicity设置为Bulk
- +
-{{ :adf:hf01.png?650 }}+
  
   * 点击Edit > Builder,设置Cell的尺寸(如下图所示则为30*30*30立方埃的一个立方盒子,当然尺寸可以根据自己的需要随意修改,但修改的时候要注意这影响着浓度、密度,更详细的说明,可以参考[[adf:盒子的尺寸设置多大|]])   * 点击Edit > Builder,设置Cell的尺寸(如下图所示则为30*30*30立方埃的一个立方盒子,当然尺寸可以根据自己的需要随意修改,但修改的时候要注意这影响着浓度、密度,更详细的说明,可以参考[[adf:盒子的尺寸设置多大|]])
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   * **补充说明:**   * **补充说明:**
  
-如果输入的分子式,软件自带的库里面没有,那么就需要自己创建*.xyz文件,分子参考[[https://www.jianguoyun.com/p/DYMQkdsQmZ2ZBhiz-60C|建模:ADF模块分子的基本建模功能演示(视频)]];创建完毕之后,在Input窗口点击菜单栏File > Export Coordinates,如此将该分子结构保存成某个名字为*.xyz的文件。要记住保存的位置,便于后面导入分子的时候,找到这个分子的xyz文件。+如果输入的分子式,软件自带的库里面没有,那么就需要自己创建*.xyz文件,建模的操作,参考[[adf:buildmodel|AMS软件建模教程]];创建完毕之后,在Input窗口点击菜单栏File > Export Coordinates,如此将该分子结构保存成某个名字为*.xyz的文件。要记住保存的位置,便于后面导入分子的时候,找到这个分子的xyz文件。
  
 导入*.xyz文件的方式:点击如下窗口所示的按钮之后,选中前面保存的*.xyz文件即可。 导入*.xyz文件的方式:点击如下窗口所示的按钮之后,选中前面保存的*.xyz文件即可。
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   * 注意,由于ReaxFF没有考虑重力,所以,无法区分气体与液体,一律以超临界状态呈现。   * 注意,由于ReaxFF没有考虑重力,所以,无法区分气体与液体,一律以超临界状态呈现。
 +  * 如果要将某个分子,位置平移到盒子的中心,可以如下操作:选中该分子的一个原子,CTRL m选中整个分子,菜单栏Edit - Set Origin,即可。
adf/creatsurfaceofliquid.1575965645.txt.gz · 最后更改: 2019/12/10 16:14 由 liu.jun

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