adf:creatsurfaceofliquid

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--- adf:creatsurfaceofliquid [2019/12/10 16:13] – liu.jun
+++ adf:creatsurfaceofliquid [2024/02/05 12:33] (当前版本) – liu.jun
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-=====创建均匀混合物======
+=====【入门基础教程】创建均匀混合物======
-打开ADFinput，切换到ReaxFF模块：
+打开AMSinput，根据需要切换到ReaxFF或DFTB、BAND模块，检查周期性Periodicity设置为Bulk：
-{{ :adf:hf01.png?650 }}
   * 点击Edit > Builder，设置Cell的尺寸（如下图所示则为30*30*30立方埃的一个立方盒子，当然尺寸可以根据自己的需要随意修改，但修改的时候要注意这影响着浓度、密度，更详细的说明，可以参考[[adf:盒子的尺寸设置多大|]]）
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 {{ :adf:hf05.png?650 }}
-点击“Generate Molecules”，这样上面设置的两种分子就会产生到左边的窗口，如下图所示：
+  * 点击“Generate Molecules”，这样上面设置的两种分子就会产生到左边的窗口，如下图所示：
 {{ :adf:hf06.png?650 }}
-**补充说明：**
+  * **补充说明：**
-如果输入的分子式，软件自带的库里面没有，那么就需要自己创建*.xyz文件，创建分子参考[[https://www.jianguoyun.com/p/DYMQkdsQmZ2ZBhiz-60C|建模：ADF模块分子的基本建模功能演示（视频）]]；创建完毕之后，在Input窗口点击菜单栏File > Export Coordinates，如此将该分子结构保存成某个名字为*.xyz的文件。要记住保存的位置，便于后面导入分子的时候，找到这个分子的xyz文件。
+如果输入的分子式，软件自带的库里面没有，那么就需要自己创建*.xyz文件，建模的操作，参考：[[adf:buildmodel|AMS软件建模教程]]；创建完毕之后，在Input窗口点击菜单栏File > Export Coordinates，如此将该分子结构保存成某个名字为*.xyz的文件。要记住保存的位置，便于后面导入分子的时候，找到这个分子的xyz文件。
 导入*.xyz文件的方式：点击如下窗口所示的按钮之后，选中前面保存的*.xyz文件即可。
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 {{ :adf:hf07.png?650 }}
-Generate Molecules得到二者的均匀混合物：
+  * Generate Molecules得到二者的均匀混合物：
 {{ :adf:hf08.png?650 }}
-注意，由于ReaxFF没有考虑重力，所以，无法区分气体与液体，一律以超临界状态呈现。
+  * 注意，由于ReaxFF没有考虑重力，所以，无法区分气体与液体，一律以超临界状态呈现。
+  * 如果要将某个分子，位置平移到盒子的中心，可以如下操作：选中该分子的一个原子，CTRL m选中整个分子，菜单栏Edit - Set Origin，即可。

adf/creatsurfaceofliquid.1575965623.txt.gz · 最后更改: 2019/12/10 16:13 由 liu.jun

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