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adf:clusterfloating

Linux集群浮动许可:安装、获取机器码、申请license、安装license

AMS软件本身并不区分正式版、试用版。对于试用版和正式版的区分,是在license文件,以及法律意义的授权协议上面。因此无论是试用版还是正式版,安装过程都是按照如下步骤(以2022.103版为例,其他版本类似)。

第一步,解压软件

安装包上传到在目标文件夹,例如(/home/UserID/AMS),并在该目录中解压AMS安装包:

cd 
tar zxf ./ams2022.103.pc64_linux.intelmpi.bin.tgz 

这样会生成文件夹/home/UserID/AMS/ams2022.103。其中UserID指代具体用户名,下同。

第二步,设置环境变量

在解压生成的AMS2022.103目录内,有一个文件,名为amsbashrc.sh,里面包含了AMS所需的环境变量。用户需要酌情考虑是否将临时文件夹从默认的/tmp更改为其他路径,例如作业当前目录,如果需要则在amsbashrc.sh最后添加一行(或在pbs脚本中source语句后,添加一行):

export SCM_TMPDIR=$PWD
  • SCM_TMPDIR所指向的这个目录,要注意经常清理,避免大量垃圾堆积;
  • 该目录最好是在高速读写硬盘中,如果用户不清楚,可以使用默认值(/tmp一般就在高速硬盘中);
  • 这个目录对AMS用户需要有读写权限,当然一般/tmp对所有用户都有读写权限;
  • (购买软件无限核license的用户忽略此条)。购买软件核数较少的用户,可以酌情增加一行环境变量:export SCM_WAIT_LICENSE=9999999999。如果用户提交的作业,所需核数大于购买的核数,那么AMS程序就会等待前面任务完成,再自动运行后面等待的任务,但这个等待时间默认只有600秒,之后就会杀死这个等待的任务。为了与PBS、LSF系统更好的配合,可以将这个等待时间提高到很大,这样只要PBS、LSF没有杀死它,它就一直等待,从而更方便。

如果是ReaxFF用户,还建议增加一行:

export OMP_NUM_THREADS=1

第三步,创建浮动目录,获取浮动信息

mkdir /home/UserID/AMS/AMSFloat  (注意,浮动目录可以在用户可以读写执行的任何位置)
cd /home/UserID/AMS/AMSFloat
mkdir FloatADF       (如果没有购买ADF模块,就不需要创建FloatADF)
mkdir FloatBAND      (如果没有购买BAND模块,就不需要创建FloatBAND)
mkdir FloatReaxFF    (如果没有购买ReaxFF模块,就不需要创建FloatReaxFF)
mkdir FloatDFTB      (如果没有购买DFTB模块,就不需要创建FloatDFTB)
mkdir FloatMLPot     (如果没有购买MLPot模块,就不需要创建FloatMLPot)
chmod 1777 Float*
ls -lid $PWD/Float*

将产生的一行或几行信息的文本收集起来。注意,Float*目录创建之后,不能改动,删除之后原位置重建也不可以因此,Float*目录没有放在/home/UserID/AMS/ams2022.103下面,这样以后安装新版本时,就不需要再提供机器码,新license可以直接使用

第四步,获取机器码,用于申请license

节点信息

登录节点(提交作业时所在的节点),以及几个代表性计算节点(代表性节点指节点名字是一系列的,比如一个集群有100个计算节点,分三类命名,其中20个节点叫做node*,30个节点叫做cn*,50个节点叫做compute*,那么需要取的机器码就是主节点,以及三类计算节点分别任取两台)运行:

source /home/UserID/AMS/ams2022.103/amsbashrc.sh
dirac info

将这些节点上dirac info命令产生的输出内容,与第三步中产生的信息一起保存为文本文件,作为机器码

第五步,提交机器码

提交机器码:由注册人邮箱将机器码发送给费米科技(ams@fermitech.com.cn或相关人员),用于license的申请。邮件内容中请说明:单位、注册人、申请正式许可还是试用许可。如果不是注册人本人提交,需要抄送给注册人邮箱一般提交机器码之后,1~3工作日内会把license发给您,如果3天仍然没有收到,您可以联系我们查询一下进度。

第六步,安装license

用户收到license.txt文件之后,将该文件放置在AMS安装文件夹(如ams2022.103)中,之后即可正常使用。安装过程中有任何问题,可以发邮件到ams@fermitech.com.cn,说明尽量全面的报错的信息,我们将提供有效的协助。

第七步:如何提交作业

PBS/LSF提交作业的时候,source /home/UserID/AMS/ams2022.103/amsbashrc.sh将会添加到PBS/LSF脚本中。如果是SLURM系统,用户可以把source /home/UserID/AMS/ams2022.103/amsbashrc.sh写到~/.bashrc文件最后一行,之后source ~/.bashrc即可提交作业。

具体参考:集群、超算:通过PBS、LSF或SLURM脚本提交任务、设定任务核数

adf/clusterfloating.txt · 最后更改: 2023/11/28 23:19 由 liu.jun

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