adf:changeofgibbs2020
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| adf:changeofgibbs2020 [2021/11/30 16:50] – [3，计算公式1中第三项] liu.jun | adf:changeofgibbs2020 [2022/01/20 19:28] (当前版本) – liu.jun | ||
|---|---|---|---|
| 行 15: | 行 15: | ||
| 第三项：氧化产物PC< | 第三项：氧化产物PC< | ||
| - | 我们以该文的Supporting Information的Table S1中PC1(+2)为例，说明$PC1^{2+}$的这三个部分数值如何计算。下文中，PC1（2+）是文献中的表示方法，即PC1< | + | 我们以该文的Supporting Information的Table S1中PC1(+2)为例，说明PC1<sup>2+</ |
| **表S1：** | **表S1：** | ||
| 行 22: | 行 22: | ||
| {{ : | {{ : | ||
| =====一、准备公式中所需各项数据===== | =====一、准备公式中所需各项数据===== | ||
| - | ====1，计算$PC1^{2+}$的气相Gibbs自由能==== | + | ====1，计算PC1<sup>2+</ |
| 也即表S1中的Gas-phase。计算前需要优化气相结构，计算方法参考费米维基：[[adf: | 也即表S1中的Gas-phase。计算前需要优化气相结构，计算方法参考费米维基：[[adf: | ||
| 结果应与文献中数值略有差别，文献中为**-9091.7579kcal/ | 结果应与文献中数值略有差别，文献中为**-9091.7579kcal/ | ||
| - | ====2，类似地计算$PC1^{2+}$在MeCN溶液中的Gibbs自由能==== | + | ====2，类似地计算PC1$^{2+}$在MeCN溶液中的Gibbs自由能==== |
| 与上一步计算的区别仅仅在于多了model > Salvation的溶剂化设置，当然也需要在设置溶剂化的前提下，进行结构优化。类似地得到Gibbs free energy。 | 与上一步计算的区别仅仅在于多了model > Salvation的溶剂化设置，当然也需要在设置溶剂化的前提下，进行结构优化。类似地得到Gibbs free energy。 | ||
| 行 35: | 行 35: | ||
| 说明：MeCN在AMS的溶剂库里面没有，因此溶剂选项改为UserDefined，否则用户只需要直接选取溶剂即可。如何自定义呢？用户需要输入上图红框中要求的两个内容：介电常数、溶剂分子的“半径”，该半径可以估算出来的。实际上一般分子也不是球形，因此“半径”本身是一个“人为性”很大的量。 | 说明：MeCN在AMS的溶剂库里面没有，因此溶剂选项改为UserDefined，否则用户只需要直接选取溶剂即可。如何自定义呢？用户需要输入上图红框中要求的两个内容：介电常数、溶剂分子的“半径”，该半径可以估算出来的。实际上一般分子也不是球形，因此“半径”本身是一个“人为性”很大的量。 | ||
| - | ====3，$PC1^{3+}$的气相Gibbs自由能以及在MeCN溶液中的Gibbs自由能==== | + | ====3，PC1<sup>3+</ |
| - | 依照上述类似的方法，分别计算$PC1^{2+}$去掉一个电子之后，$PC1^{3+}$的气相Gibbs自由能以及在MeCN溶液中的Gibbs自由能（均需先做结构优化）。 | + | 依照上述类似的方法，分别计算PC1<sup>2+</ |
| =====二、溶液中氧化还原Gibbs自由能变化分===== | =====二、溶液中氧化还原Gibbs自由能变化分===== | ||
| 行 62: | 行 62: | ||
| ====3，计算公式1中第三项==== | ====3，计算公式1中第三项==== | ||
| - | PC< | + | PC< |
| ΔG(solv.PC+) | ΔG(solv.PC+) | ||
| 行 72: | 行 72: | ||
| =-289.8 kcal/mol | =-289.8 kcal/mol | ||
| - | ====4，计算$PC1^{2+}$在MeCN溶液中氧化还原Gibbs自由能变化==== | + | ====4，计算PC1<sup>2+</ |
| △G< | △G< | ||
| - | =ΔG(gas)+ΔG(solv.PC)-ΔG(solv.PC$^+$) | + | =ΔG(gas)+ΔG(solv.PC)-ΔG(solv.PC<sup>+</ |
| =-296.3+（-121.4）-(-289.8) | =-296.3+（-121.4）-(-289.8) | ||
| =-127.9 kcal/mol | =-127.9 kcal/mol | ||
adf/changeofgibbs2020.1638262209.txt.gz · 最后更改: 2021/11/30 16:50 由 liu.jun