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adf:cddofgs

这是本文档旧的修订版!


如何计算片段差分密度(即:分子与片段的电子密度之差、碎片形成整体导致的电荷转移方向)

本例以BH3-NH3为例:

第一步,优化基态的分子结构(详情请点击);

第二步,导入优化好的分子结构,划分片段,进行计算,如下图所示:

按住Shift键,鼠标画框,选中NH3,然后选择右侧窗口的Model > Region,点击加号,如下图

则成功将NH3设定为Region_1;可以用同样的方式,将BH3设定为Region_2,如下图所示(切记避免个别原子既被归入一个区,又被归入另一个区)

启动片段功能:

主面板参数设置如下图所示(基组、泛函选择参考“优化基态的分子结构(详情请点击)”)

保存任务,并运行。

第三步,结果查看:

在ADFinput窗口点击SCM LOGO > View,弹出View窗口。点击Field > Calculated,下方选择

注意上图左下角的C-1,这是“分子电荷密度-片段结合为分子之前的电子密度之和=基态差分电荷密度”的标号。后面会用到这个标号。

Add — Isosurface: With Phase,之后选择C-1如下图所示:

之后,即显示基态的差分电荷密度:分子电子密度与各片段电子密度之差。调整等值面的值,如图中所示,此例调整为0.01显示的比较清楚,分别更改为其他数值,例如0.03等等,这样能够了解在空间的分布情况。

图中红色与蓝色,表示电子的流向。其中蓝色区域表示得到电子,红色区域表示失去电子。

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adf/cddofgs.1542469786.txt.gz · 最后更改: 2018/11/17 23:49 由 liu.jun

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