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adf:bondpath_cps

这是本文档旧的修订版!


晶体中键径、(原子、键、环、笼)临界点、Laplacian电子密度的计算

建模

以$Na_2CO_3$为例进行演示。从American Mineralogist Crystal Structure Database可以免费下载其晶体结构的cif格式文件,通过ADFinput > Import Coordinates导入该晶体即可。

参数设置

保存任务并运行。

结果查看

点击SCM Logo > View > Properties > AIM(Bader)。点击窗口左下方AIM > Show details,并改动选项如下:

其中:

  • Color:Laplacian表示显示键径上的Laplacian电子密度
  • Critical Points和Bond Path的Radius值调整显示CP点的小球的大小和键径的粗细
  • 修改Colormap,使得正负值颜色差别较大,便于观察
  • 勾选Bar显示不同颜色对应的Laplacian电子密度正负值
  • 范围-0.2~0.2是为了区分清楚键径部分区域Laplacian绝对值很小的区域
  • 要查看对应的元素,可以按Ctrl和减号(或加号)缩小(或放大)原子
  • 用不同颜色的小球限制了原子、键、环、笼临界点,颜色如窗口下方所示

也可以通过观察键径上的临界点,观察键的类型,具体可以参考如何通过计算拉普拉斯电子密度区分共价键和离子键

adf/bondpath_cps.1477916181.txt.gz · 最后更改: 2016/10/31 20:16 由 liu.jun

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