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adf:ams2019.301

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adf:ams2019.301 [2019/12/13 16:45] – [3,ReaxFF中计算热导率的NEMD方法] liu.junadf:ams2019.301 [2020/04/19 17:25] (当前版本) – [2,高精度Double Hybrid泛函] liu.jun
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-======AMS2019.301新功能======+======AMS2019.3新功能======
 =====第一性原理===== =====第一性原理=====
 ====1,MP2、SOS-MP2==== ====1,MP2、SOS-MP2====
-  * **改进:**+  * **优点:**
      * 对氢键的计算,结合能略高于实验值,而一般DFT则总是倾向于低估,总体而言MP2在这方面优于一般DFT;      * 对氢键的计算,结合能略高于实验值,而一般DFT则总是倾向于低估,总体而言MP2在这方面优于一般DFT;
      * 计算饱和有机物二聚体尤其精确。计算时,要求TZ2P及其以上的基组。      * 计算饱和有机物二聚体尤其精确。计算时,要求TZ2P及其以上的基组。
行 9: 行 9:
   * **不支持:**激发态、极化率、IR、NMR等相关计算。   * **不支持:**激发态、极化率、IR、NMR等相关计算。
 ====2,高精度Double Hybrid泛函==== ====2,高精度Double Hybrid泛函====
-  * **改进:**+  * **优点:**
      * 从文献以及厂商测试结果来看,在异构体能量差、能垒、过渡态能量方面有非常显著的改进      * 从文献以及厂商测试结果来看,在异构体能量差、能垒、过渡态能量方面有非常显著的改进
      * 在分子间色散作用、非共价作用方面,比色散修正杂化泛函仅有细微改进。      * 在分子间色散作用、非共价作用方面,比色散修正杂化泛函仅有细微改进。
      * 对过渡金属体系,结合ZORA方法,结果相当精确。      * 对过渡金属体系,结合ZORA方法,结果相当精确。
   * **效率:**对于三四十个原子的体系,计算量比杂化泛函的二倍略小。   * **效率:**对于三四十个原子的体系,计算量比杂化泛函的二倍略小。
-  * **用法:**大体系的计算,双杂化泛函中,推荐DOD类泛函。一般的计算,根据我们的测试,B2piPLYP、B2KPLYP及其-D3(BJ)色散修正,以及revDSD-BLYP、revDSD-PBEP86,都非常优秀。后两个泛函的DOD变体比DSD变体更精确,更适合大体系计算。总的来说,双杂化泛函对很多体系都能够提供相当高精度的计算,对很多体系,这些不同的双杂化泛函结果差异实际上并不大。+  * **用法:**大体系的计算,双杂化泛函中,推荐DOD类泛函。一般的计算,根据我们的测试,B2piPLYP、B2KPLYP及其-D3(BJ)色散修正,以及revDSD-BLYP、revDSD-PBEP86,都非常优秀。后两个泛函的DOD变体比DSD变体更精确,更适合大体系计算。总的来说,双杂化泛函对很多体系都能够提供相当高精度的计算,对很多体系,这些不同的双杂化泛函结果差异实际上并不大。使用该泛函时,在基组方面推荐TZ2P基组(QZ4P有可能数值不稳定),积分精度选择Normal即可,相对论推荐Scalar。涉及的色散修正,推荐D4或D3(BJ)
   * **支持:**EDA、NOCV分析,只支持单点计算   * **支持:**EDA、NOCV分析,只支持单点计算
   * **不支持:**激发态、极化率、IR、NMR等相关计算。不要用于HOMO-LUMO gap很小的体系,或者具有多参考态特征的体系。   * **不支持:**激发态、极化率、IR、NMR等相关计算。不要用于HOMO-LUMO gap很小的体系,或者具有多参考态特征的体系。
行 28: 行 28:
 ====6,CI-NEB:应用于各模块==== ====6,CI-NEB:应用于各模块====
  
-====7,添加应力====+====7,支持应力====
  
 用法参考:[[adf:externalstress]] 用法参考:[[adf:externalstress]]
  
 +====8,活化应变模型理解化学反应性====
 +  * [[https://www.scm.com/doc/ADF/Input/PyFrag.html|使用手册(点击)]]
 +  * 最新应用案例:[[https://www.nature.com/articles/s41596-019-0265-0|使用活化畸变模型理解化学反应性(Nature Protocols 2020)]]
 =====分子动力学===== =====分子动力学=====
 ====1,微观反应动力学==== ====1,微观反应动力学====
-[[https://www.scm.com/doc/Tutorials/Microkinetics/Microkinetics-GUI_tutorials.html|Microkinetics]]+方法介绍:[[https://www.scm.com/doc/Tutorials/Microkinetics/Microkinetics-GUI_tutorials.html|Microkinetics]] 
 例子:https://www.scm.com/doc/Tutorials/Microkinetics/MKMCXX_CO_Oxidation.html 例子:https://www.scm.com/doc/Tutorials/Microkinetics/MKMCXX_CO_Oxidation.html
 ====2,新的分子动力学反应加速算法REMD==== ====2,新的分子动力学反应加速算法REMD====
 用法参考:[[adf:REMDofAMS]]。适用于BAND-MD、DFTB-MD、MOPAC-MD、ReaxAMS-MD。 用法参考:[[adf:REMDofAMS]]。适用于BAND-MD、DFTB-MD、MOPAC-MD、ReaxAMS-MD。
-====3,ReaxFF中计算热导率的NEMD方法==== 
-参考:https://www.scm.com/doc/ReaxFF/Properties.html#nemd-methods-for-thermal-conductivity 
  
 =====VASP GUI===== =====VASP GUI=====
 +为VASP制作输入文件。
adf/ams2019.301.1576226751.txt.gz · 最后更改: 2019/12/13 16:45 由 liu.jun

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