这里会显示出您选择的修订版和当前版本之间的差别。
两侧同时换到之前的修订记录前一修订版后一修订版 | 前一修订版 | ||
adf:1hnmrwithssc [2019/12/06 22:34] – [第二步:NMR计算] liu.jun | adf:1hnmrwithssc [2020/11/12 17:06] (当前版本) – 移除 liu.jun | ||
---|---|---|---|
行 1: | 行 1: | ||
- | ======NMR化学位移、自旋-自旋耦合-NMR化学位移====== | ||
- | 使用ADF的图形界面,可以直接对比计算结果与实验结果: | ||
- | |||
- | {{ : | ||
- | |||
- | 计算前,请务必参考: | ||
- | * [[adf: | ||
- | * [[adf: | ||
- | |||
- | 本教程使用AMS2019.301完成 | ||
- | =====第一步:结构优化===== | ||
- | 参考:[[adf: | ||
- | * Hybrid:PBE0 | ||
- | * Basis: TZP | ||
- | * Frozen core: None | ||
- | * Numerical Quality: Good | ||
- | |||
- | [[https:// | ||
- | |||
- | =====第二步:NMR计算===== | ||
- | {{ : | ||
- | |||
- | {{ : | ||
- | |||
- | 注意: | ||
- | * 如果只需要计算其中一部分原子的NMR,可以在窗口左边选中这些原子,然后点击右方窗口NMR shielding for atoms后面的➕; | ||
- | * 如果只考虑部分原子对某些原子的自旋-自旋耦合,可以分别选中这些原子,在下方的Perturbing atoms和Responding atoms后面的➕,Perturbing atoms对Responding atoms进行微扰,用户也可以不勾选上面的元素框,改为一一选择设置 | ||
- | * 如果不考虑自旋-自旋耦合,则不设置上图中Spin-Spin Coupling即可。 | ||
- | * 基组中,J-TZ2P或QZ4P是专用于NMR计算的基组 | ||
- | |||
- | 保存任务,并运行。 | ||
- | |||
- | =====第三步:结果查看===== | ||
- | ====NMR化学位移、自旋-自旋耦合常数==== | ||
- | {{ : | ||
- | ====查看$^1$H-NMR谱==== | ||
- | |||
- | ADF LOGO > Spectra: | ||
- | |||
- | {{ : | ||
- | |||
- | 这是没有自旋-自旋耦合的结果。每个峰都对应着某个原子,点击这些原子,对应的峰也被选中了。对这个分子而言,中间的两个H原子是等价的,因此可以进行平均:选中左边窗口的这两个H原子,按Ctrl G(或者点击菜单Regions → New Region From Selected Atoms)这样,谱图就对这两个H原子进行了平均。类似地,可以分别对两个甲基上的三个H原子进行平均。从而得到只有三个峰的谱图。 | ||
- | |||
- | ====查看加入自旋-自旋耦合的$^1$H-NMR谱==== | ||
- | |||
- | 点击谱图窗口右下角的Coupling勾选框,谱图就变为了自旋-自旋耦合分裂的图谱: | ||
- | |||
- | {{ : | ||
- | |||
- | ====与实验对比==== | ||
- | |||
- | 不要关闭上面的谱图窗口。在http:// | ||
- | |||
- | {{ : | ||
- | |||
- | 选择ethyl acetate的HNMR数据: | ||
- | |||
- | {{ : | ||
- | |||
- | 点击窗口左下角的“peak data”,复制这些数据: | ||
- | <code bash> | ||
- | 379.88 | ||
- | 372.75 | ||
- | 365.56 | ||
- | 358.50 | ||
- | 182.56 | ||
- | 119.69 | ||
- | 112.63 | ||
- | 105.38 | ||
- | </ | ||
- | |||
- | 回到ADF的谱图窗口,直接ctrl v粘贴这些数据,会弹出提示,问图谱的x值是第几列数据,显然是上面的第1列,图谱的y显然是上面的第2列数据。所以在对话框分别输入1和2即可看到是实验谱和计算谱在同一个窗口了。 | ||
- | |||
- | 还应该修改Coupling后面的频率(默认值为200MHz),本例中,实验上,是用89.56Hz的信号去检测的,因此可以修改为89.56: | ||
- | |||
- | {{ : |