这是本文档旧的修订版!
本功能适合于AMS2023及以后的版本。
注意两种重启的模式,所调用的轨迹文件不同。如果选择错误,作业会报错。
Model - MD - Restart from,这里选择任务生成的*.results/ams.rkf(如果直接复制之前最后一帧的结构到Input窗口,则此处可以不设置restart,只读取最后一帧的速度即可),如果起始速度也要沿用之前作业的原子速度大小方向,可以在Initial velocity中设置From File并选择相同的*.results/ams.rkf:
修改步数,另存一个任务计算。
注意:
Model - Restart,读取*.results/MDstep*.rkf,其中*为之前任务的Step数,默认每隔1000步存一次重启点。因此可以从1000步的整数倍开始重启。这种方式重启,无法读取速度。如果是在集群,无法使用图形窗口的情况,在本地保存好作业,将*.run、*.results/MDstep*.rkf上传到集群,更正*.run中*.results/MDstep*.rkf文件的具体路径,提交作业即可。
合并之后的轨迹,可以用ChemTraYzer2进行分析。