首先我们需要知道我们关心的原子群体的编号，一般在建模的时候，可以检查一下，例如：

在AMSInput窗口，Model - Coordinates列表里面可以看到具体原子的序号。

Movie - View - Details(Color,Radius,Mass,…)中选中对应原子，为他们设定特殊的颜色：

这样在Movie中就可以比较方面的追踪了。