计算机的多核心CPU，例如64核，就相当于有64个人。主频高，表示单人的办事能力高，但可能不同品牌的CPU，评价机制不一样。
比如提交了3个A软件的作业，每个作业使用16核；然后B软件提交3个作业，每个作业使用16核。相当于64个人要干16*3+16*3=96件事，CPU的核心只能在不同事情之间来回切换，效率当然受影响！
如果计算机只有64核，但是提交的作业，所需的核数超过了64，那么CPU就只能在不同的作业间暂停、切换，从而导致效率低下！
一般计算，都最好留一个空闲核心，用于系统本身正常工作，例如打开桌面，打开文件夹，阅读文件，打开网页等等。所有核心都被占据，必然导致电脑非常卡！请有此常识！
打扫一个教室，可能1个人半小时打扫完毕，4个人可能几分钟完成。但是要求一千个人来打扫这件教室，会更快吗？你需要先开个大会，交代清楚每个人何时做何种事情，然后是嘈杂的互相交流信息、等待其他人完工轮到自己……整个过程做完，可能半天就过去了。笼统的比喻来说，沟通的这个过程，就是节点间通信，大部分时间消耗在这里了。通信更高效，能一定程度上提高效率，尤其是调用核数较多时。
总的来说，效率随核心数增加，一般呈现先增高，后降低的趋势。小的作业，效率最高点的核心数较小，大型作业效率最高点的核心数较大。故意把作业搞大，以增大核数，这是不可能提高效率的。
对DFT而言，几十个原子就是比较大的作业，而且精度越高，作业越大。对力场而言，一般几千原子属于较小体系。对ReaxFF而言，一般每1000原子用1个核心就可以了，2个核心效率略有提升。
ReaxFF这种分子动力学计算，对CPU需求并不太大，但是体系越大，使用核数越多，内存的需求越大，而DFT计算一般是CPU和内存都会高占据。
一般对于工作站、台式机、笔记本，这种影响可以忽略。对于集群，文件夹所在的硬盘分为两种类型：
软件在计算的过程中，会有大量的临时文件的读、写过程，如果这个过程，是发生在第二种区域，那么很显然就会大大拖慢计算速度。因此一般临时文件非常不建议存到这种区域里面。一般/tmp文件夹属于第一种，但是就需要集群管理员，设置一些自动定期清理/tmp文件的功能，避免/tmp堆满文件。
另外，硬盘本身的转速也会影响计算效率，因此临时文件读写区域，一般建议放在具有高速读写能力的那块硬盘上。
一般不影响。因为计算开始，程序被读入本地内存，在CPU中执行，跟硬盘位置就没有太大关系了。