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--- sw:多标签掩膜和报告 [2023/07/20 18:14] – [多标签掩膜和生成报告] liu.ning
+++ sw:多标签掩膜和报告 [2023/07/24 20:54] (当前版本) – liu.ning
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 ==== 1.1 分割数据 ====
+点击 File — Open（或 Welcome 页面的 Open），打开 Pre-segmentedVolume.sip 预分割项目文件。
+在菜单栏 View — 2D slice views — Orientation，确保选择的是 Classic。
+  - 点击 Image Processing — Segmentation — Advanced，从下拉菜单中选择 Pre-segmented data mask generator。
+  - 在打开的 Pre-segmented data mask generator 工具页面设置 Lower Value 和 Upper value 分别为 0 和 255。
+  - 在 Apply on 的下拉菜单选择 All slices。
+  - 确保勾选 Output to a multi-label mask。<WRAP center round box 60%>
+{{ :sw:20230721ln01.png?nolink&400 |}}
+ 图：Pre-segmented data mask generator 工具页面
+</WRAP>
+  - 点击 Apply。
+  - 已在 Dataset browser 区域成功创建名称为 Mask 1 的多标签掩膜。
+  - 在 3D 视图中打开 Live 3D。
+<WRAP center round box 60%>
+{{ :sw:20230721ln02.png?nolink&400 |}}
+图：Simpleware ScanIP 中生成多标签掩膜的快速预览
+</WRAP>
 ==== 1.2 掩膜标签编辑器 ====
+掩膜标签编辑器可以根据各种不同的数据更改标签的颜色，对于 3D 视图的可视化非常有用，也可以将统计数据导出为 .csv 文件用于后处理。
+  - 点击 Measurements — Mask labels Mask — Mask label editor。
+  - 默认展示标签出现率和体素总数的关系直方图。<WRAP center round box 60%>
+{{ :sw:20230721ln03.png?nolink&400 |}}
+图：Mask label editor 中展示的体素总数直方图
+</WRAP>
+  - 在 Metric 的下拉菜单中选择 Surface area。
+  - 点击 Apply，直方图将自动更新，2D 切片视图和 3D 视图也将匹配为新的标签颜色。<WRAP center round box 60%>
+{{ :sw:20230721ln04.png?nolink&400 |}}
+图：Mask label editor 中展示的表面面积直方图
+</WRAP>
+  - 通过点击 Data bins... 可以自定义直方图，也可以通过 Units... 调整单位。
+  - 点击 Export 以 *.csv 文件格式导出当前数据。
+  - 更改 Mode 为 Advanced editing，将展示多标签掩膜列表。<WRAP center round box 60%>
+{{ :sw:20230721ln05.png?nolink&400 |}}
+图：Advanced editing 模式下的 Mask label editor
+</WRAP><WRAP center round alert 100%>
+当使用预分割数据时，默认的注释代表每种颗粒的灰度。要将此信息保留在导出的网格文件中，请保持注释原样。否则，可以通过右键单击标签并选择 Annotate.... 编辑注释。</WRAP>
+  - 点击 Surface area 栏将按照表面面积从小到大的顺序排列标签，再次点击将切换为从大到小，即 Label 02 面积最大在列表最上面。其他项目栏也可以用作调整标签的排序。
+  - 如果想要仅显示最大的表面面积，右键单击 Label 02 选择 Isolate。3D 视图将更新为只显示这一个标签。点击View — 3D display — Widgets，选择显示 Outline 可以显示图像体积的边界。
+<WRAP center round box 60%>
+{{ :sw:20230721ln06.png?nolink&400 |}}
+图：单独显示具有最大表面面积的标签
+</WRAP>
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+  - 点击 View 2D — slice views — Slice cursors，显示切片光标。
+  - 在 Mask label editor 单独显示 Label 09。
+  - 点击 Label 09 右键选择 Focus views，2D 切片视图和切片光标都会更新定位到 Label 09 所在的体素。
-===== 2.网格划分 =====
+<WRAP center round box 60%>
+{{ :sw:20230721ln07.png?nolink&400 |}}
+图：利用 Slice cursors 在 2D 视图定位 Label 09
+</WRAP>
+===== 2. 网格划分 =====
 ==== 2.1 为划分网格创建模型 ====
+  - 在 Dataset browser 右键单击Models 选择 Create a new FE model。
+  - 将 Mask 1 拖拽到 Model 1 (FE)。
 ==== 2.2 导出标签接触表面（可选） ====
+在某些情况下，每个标签都有自己的接触表面会非常有用。这样可以对诸如颗粒间界面运动等相互作用建模。
+**设置导出标签接触表面的模型**
+  - 右键单击 Model 1 (FE) 选择 Model configuration...。
+  - 在 Export type 选择所需导出模型对应的格式。
+  - 点击 Contacts 栏，勾选 Export label contact surfaces。
+  - 关闭 Model configuration 对话框。
+<WRAP center round box 60%>
+{{ :sw:20230721ln08.png?nolink&400 |}}
+图：Model configuration 对话框的 Export label contact surfaces 选项
+</WRAP>
 ==== 2.3 生成网格 ====
+  - 点击 FE Model — General — Full Model 开始进行网格划分。
+  - 产生的最终网格模型如下图所示。
+  - 如果只有 Label 09 是可见状态，可以返回到 Mask label editor 设置所有标签可见。（通过 Shift 键选中所有标签，右键选择 Isolate）
+<WRAP center round box 60%>
+{{ :sw:20230721ln09.png?nolink&400 |}}
+图：生成的 FE 网格
+</WRAP>
 ==== 2.4 导出并检查标签 ====
+  - 点击 FE Model — General — Export。
+  - 指定网格模型的保存路径并重命名文件。
+  - 用文本编辑器打开导出的 .inp 文件，掩膜标签以不同材质分区表示。
-===== 3.报告 =====
+<WRAP center round box 60%>
+{{ :sw:20230721ln10.png?nolink&400 |}}
+图：.inp file 文件中的两个标签
+</WRAP>
+<WRAP center round tip 100%>
+在 SOLID SECTION, ELSET=PT_MASK_1_4_082 中 1 是指 Dataset browser 中掩膜的名称，4 代表标签编号，082 则是注释。对于预分割数据，已经通过 Pre-segmented mask generator 工具分割为掩膜，默认注释是每个标签对应的灰度值。也就意味着标签保留了原始图像数据的灰度信息，可以在求解器软件中识别到。更多关于网格划分的详情，请参考手册中 Simpleware FE module 部分。
+</WRAP>
+===== 3. 报告 =====
+报告是一种可以快速便捷地获取项目中一系列统计信息的方式。在 Simpleware ScanIP 中自动为掩膜或完整的模型网格生成报告，可导出为 PDF 或 HTML 文件。为展示如何生成报告，打开一个更大的项目文件 Pre-sementedVolume_ForReport.sip。
 ==== 3.1 生成报告 ====
+  - 点击 File — Open — Pre-sementedVolume_ForReport.sip。
+  - 点击 Measurements — Reports。
+  - 在下拉菜单中选择合适的报告类型。本例项目数据中包含有颗粒，但没有完整的网格模型，因此选 Mask particles (masks) 是最为合适的。
+  - 在新窗口中显示生成的报告内容。
+<WRAP center round box 60%>
+{{ :sw:20230721ln11.png?nolink&400 |}}
+图：Mask particles (masks) 报告
+</WRAP>
 ==== 3.2 编辑报告 ====
+  - 点击窗口上方的 Add/edit 按钮。
+  - 在 Enter or edit the report's notes 对话框输入注释文本。
+  - 包含加粗、倾斜和下划线工具，选中输入的文本，点击下划线后面的 A 可以对文本格式做更多的设置。也可以对之前做过的注释进行更改。
-===== 4.参考 =====
+<WRAP center round box 60%>
+{{ :sw:20230721ln12.png?nolink&400 |}}
+图：Enter or edit the report's notes 对话框
+</WRAP>
+===== 4. 参考 =====

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