adf:tssofband
差别
这里会显示出您选择的修订版和当前版本之间的差别。
| 两侧同时换到之前的修订记录前一修订版后一修订版 | 前一修订版 | ||
| adf:tssofband [2020/04/06 19:32] – [基本参数设置] liu.jun | adf:tssofband [2023/03/18 13:39] (当前版本) – [修改优化最大步长] liu.jun | ||
|---|---|---|---|
| 行 6: | 行 6: | ||
| ====参数设置==== | ====参数设置==== | ||
| {{ : | {{ : | ||
| + | |||
| + | 关于基组的选择，参考：[[adf: | ||
| {{ : | {{ : | ||
| - | 关于基组的选择，参考：[[adf: | + | **为需要计算频率的原子，创建一个Region，然后在Properties - IR(Frequencies), |
| - | < | + | |
| - | Properties | + | |
| - | NormalModes Yes | + | |
| - | SelectedAtomsForHessian 3 12 13 14 | + | |
| - | End | + | |
| - | </ | + | |
| - | 我们添加了一行SelectedAtomsForHessian 3 12 13 14，表示我们只需要计算编号为3、12、13、14的这4个原子，也就是两个H原子和两个S原子。 | + | |
| ====注意：==== | ====注意：==== | ||
| 行 58: | 行 53: | ||
| ====修改优化最大步长==== | ====修改优化最大步长==== | ||
| 保存任务后，修改*.run文件： | 保存任务后，修改*.run文件： | ||
| + | < | ||
| GeometryOptimization | GeometryOptimization | ||
| Method Quasi-Newton | Method Quasi-Newton | ||
| 行 65: | 行 60: | ||
| | | ||
| End | End | ||
| - | UpdateTSVectorEveryStep True | ||
| End | End | ||
| InitialHessian | InitialHessian | ||
| 行 76: | 行 70: | ||
| End | End | ||
| End | End | ||
| + | </ | ||
| + | 这里我们设置了最大位移量为0.01，这样可以避免优化过程中的振荡行为，这个值越小，越利用收敛，但收敛的也越慢。 | ||
| - | 这里我们设置了最大位移量为0.01，这样可以避免优化过程中的振荡行为，这个值越小，越利用收敛，但收敛的也越慢。 | + | 保存*.run文件，并直接运行任务。 |
| ====结果查看==== | ====结果查看==== | ||
| SCM - Movie打开，收敛的最后一个结构（梯度小于阈值），也就是搜索得到的精确过渡态结构（即鞍点）。File - Save Geometry，保存结构。用于下面频率验证。 | SCM - Movie打开，收敛的最后一个结构（梯度小于阈值），也就是搜索得到的精确过渡态结构（即鞍点）。File - Save Geometry，保存结构。用于下面频率验证。 | ||
| 行 99: | 行 95: | ||
| </ | </ | ||
| 用三种单位显示了其能量。过渡态能量减去反应物能量即得到绝对0度下的能垒。 | 用三种单位显示了其能量。过渡态能量减去反应物能量即得到绝对0度下的能垒。 | ||
| - | |||
| - | 如何通过计算反应相关的部分原子的频率，近似地得到反应相关的自由能？参考：[[adf: | ||
adf/tssofband.1586172744.txt.gz · 最后更改: 2020/04/06 19:32 由 liu.jun