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adf:pesofband

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adf:pesofband [2022/12/14 11:14] – [前言] liu.junadf:pesofband [2022/12/14 11:16] (当前版本) – [前言] liu.jun
行 12: 行 12:
 第一步,通过势能面扫描,观察H<sub>2</sub>分子逐渐靠近MoS<sub>2</sub>中S原子的过程中,能量、结构的变化。实际上,这相当于做了一系列的限制性结构优化,限制的是S-H距离逐渐减小,其他原子自由地进行能量最小化。因此可以认为,如果限制条件设置得当,势能面扫描的过程,大致是沿着势能面中,反应物与产物之间,能量最低的“方向”前进的(我们这里有一个大前提,即只讨论单步反应。存在多步反应的情况,拆解为多个单步反应即可)。因此,扫描得到的势能面最高点,一般而言就在精确的过渡态结构(或者叫做势能面的**鞍点**)附近。接下来,则可以从将结构作为过渡态结构的初始猜测,去搜索精确的过渡态结构。 第一步,通过势能面扫描,观察H<sub>2</sub>分子逐渐靠近MoS<sub>2</sub>中S原子的过程中,能量、结构的变化。实际上,这相当于做了一系列的限制性结构优化,限制的是S-H距离逐渐减小,其他原子自由地进行能量最小化。因此可以认为,如果限制条件设置得当,势能面扫描的过程,大致是沿着势能面中,反应物与产物之间,能量最低的“方向”前进的(我们这里有一个大前提,即只讨论单步反应。存在多步反应的情况,拆解为多个单步反应即可)。因此,扫描得到的势能面最高点,一般而言就在精确的过渡态结构(或者叫做势能面的**鞍点**)附近。接下来,则可以从将结构作为过渡态结构的初始猜测,去搜索精确的过渡态结构。
  
-实际上也可以做两轮NEB,代替此处的势能面扫描,得到过渡态结构的初始猜测。+实际上也可以做两轮NEB,代替此处的势能面扫描,得到过渡态结构的初始猜测。NEB过程,参考:[[adf:nebandtssofband]]
  
 第二步,计算该过渡态初始猜测结构的频率(只需要计算与反应相关的少数几个原子的频率即可),然后进行过渡态结构优化,得到真正精确的过渡态,也就是能量的一阶梯度趋近于0(默认阈值0.001)。 第二步,计算该过渡态初始猜测结构的频率(只需要计算与反应相关的少数几个原子的频率即可),然后进行过渡态结构优化,得到真正精确的过渡态,也就是能量的一阶梯度趋近于0(默认阈值0.001)。
adf/pesofband.1670987670.txt.gz · 最后更改: 2022/12/14 11:14 由 liu.jun

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